More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0105 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  100 
 
 
192 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  88.48 
 
 
192 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  88.48 
 
 
192 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  87.37 
 
 
191 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  84.74 
 
 
191 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  81.77 
 
 
193 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  82.2 
 
 
191 aa  316  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  82.2 
 
 
222 aa  315  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  70.68 
 
 
193 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  66.49 
 
 
196 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  66.49 
 
 
196 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  66.49 
 
 
196 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  65.96 
 
 
197 aa  259  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  66.14 
 
 
194 aa  258  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  64.36 
 
 
197 aa  256  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  64.36 
 
 
197 aa  256  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  64.92 
 
 
198 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0356691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  58.33 
 
 
196 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  58.33 
 
 
196 aa  240  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  58.33 
 
 
196 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  58.33 
 
 
196 aa  240  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  57.81 
 
 
196 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  57.81 
 
 
196 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  57.81 
 
 
196 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  57.81 
 
 
196 aa  238  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  57.81 
 
 
196 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  50.53 
 
 
192 aa  188  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  50.27 
 
 
217 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  51.67 
 
 
185 aa  174  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  50 
 
 
212 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  51.66 
 
 
189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  44.92 
 
 
202 aa  155  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  44.15 
 
 
190 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  42.16 
 
 
190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  40.32 
 
 
318 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  39.36 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  38.25 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  36.36 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  41.4 
 
 
189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.7 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.7 
 
 
190 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  38.38 
 
 
231 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  35.83 
 
 
198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  41.94 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  39.57 
 
 
219 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  39.22 
 
 
193 aa  111  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  36.09 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  37.77 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  35.08 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  37.57 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  36.84 
 
 
210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  38.83 
 
 
188 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  40.24 
 
 
197 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 
181 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  40.64 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  40.64 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.38 
 
 
197 aa  108  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 
186 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  38.3 
 
 
205 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  36.46 
 
 
184 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 
201 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  36.36 
 
 
196 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 
188 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 
201 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 
201 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  40.64 
 
 
201 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  37.36 
 
 
180 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  37.91 
 
 
206 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 
215 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  35.16 
 
 
192 aa  105  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  40.76 
 
 
197 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  39.78 
 
 
182 aa  105  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6401  resolvase domain-containing protein  32.98 
 
 
214 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  38.25 
 
 
186 aa  104  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 
189 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 
206 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 
194 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 
186 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  39.25 
 
 
203 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  36.76 
 
 
204 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  36.76 
 
 
204 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  36.76 
 
 
204 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  40.12 
 
 
213 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  38.17 
 
 
196 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  37.23 
 
 
196 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  36.81 
 
 
193 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 
189 aa  101  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  39.25 
 
 
198 aa  101  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  36.81 
 
 
197 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  36.61 
 
 
205 aa  101  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  36.61 
 
 
205 aa  101  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  38.17 
 
 
187 aa  101  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  37.95 
 
 
191 aa  101  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  37.95 
 
 
191 aa  101  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  34.46 
 
 
184 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  36.3 
 
 
183 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>