44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1011 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  100 
 
 		 375 aa  779    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  35.43 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  34.86 
 
 		 356 aa  216  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  34.86 
 
 		 356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  34.59 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  36.32 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  35.44 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  35.75 
 
 		 359 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  35.16 
 
 		 359 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  33.98 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  35.47 
 
 		 359 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  34.07 
 
 		 362 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  33.43 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  33.43 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  35.01 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  35.26 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  33.15 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  33.15 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  33.98 
 
 		 372 aa  169  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  32.04 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  36.46 
 
 		 284 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  32.68 
 
 		 394 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  32.96 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  32.4 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  31.73 
 
 		 304 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  34.5 
 
 		 260 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  32.44 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  36.82 
 
 		 228 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2016  putative cytoplasmic protein  40.68 
 
 		 122 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2069  hypothetical protein  40.68 
 
 		 122 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7378  hypothetical protein  37.33 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0269984 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1255  integrase  42.73 
 
 		 119 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2577  hypothetical protein  30.56 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00702  hypothetical protein  50.94 
 
 		 54 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000701341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.78 
 
 		 344 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.78 
 
 		 344 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1428  hypothetical protein  47.37 
 
 		 72 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  27.69 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  26.29 
 
 		 409 aa  47  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  22.91 
 
 		 326 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 413 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  23.45 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  23.47 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  28.93 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>