More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1307 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1349  ABC transporter, permease protein, putative  99.19 
 
 
370 aa  731    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1825  ABC-2 type transporter  90.27 
 
 
370 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0526143  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1307  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 
370 aa  736    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4914  ABC-2 type transporter  81.08 
 
 
370 aa  596  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0169  hypothetical protein  74.8 
 
 
371 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3576  hypothetical protein  73.78 
 
 
370 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3659  putative ABC transporter (permease protein)  72.97 
 
 
370 aa  535  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00759514  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1505  ABC-2 type transporter  71.39 
 
 
373 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.366767  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4687  ABC-2 type transporter  72.63 
 
 
370 aa  528  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.696171  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4663  hypothetical protein  75.14 
 
 
370 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2685  hypothetical protein  72.13 
 
 
373 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1496  ABC-2 type transporter  68.85 
 
 
382 aa  511  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.679397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2362  ABC-2 type transporter  68.85 
 
 
382 aa  511  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0759041  normal  0.863187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3418  ABC-2 type transporter  70.49 
 
 
373 aa  510  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0626  ABC-2 type transporter  72.68 
 
 
373 aa  505  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  65.66 
 
 
376 aa  494  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0758  ABC-2 type transporter  69.15 
 
 
376 aa  485  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1951  ABC-2 type transporter  66.67 
 
 
373 aa  484  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171698  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1683  multidrug ABC transporter permease component  66.85 
 
 
397 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0017586  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0166  hypothetical protein  66.58 
 
 
374 aa  478  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000154077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16770  ABC-2 type transporter, permease component  62.7 
 
 
372 aa  471  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00841824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2181  ABC-2 type transporter  65.57 
 
 
374 aa  473  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64312  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2341  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  64.66 
 
 
374 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612393  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0437  ABC transporter, permease  63.56 
 
 
374 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0138  ABC transporter, permease  63.29 
 
 
374 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1308  ABC transporter, permease protein  63.29 
 
 
374 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2634  ABC transporter, permease protein  63.01 
 
 
374 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0164  ABC transporter, permease protein  63.29 
 
 
374 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0920361  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2777  ABC-type multidrug transport system, permease component  63.01 
 
 
374 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69060  putative permease of ABC transporter  63.19 
 
 
374 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1040  ABC transporter, permease  62.74 
 
 
374 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0171  hypothetical protein  64.93 
 
 
375 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5973  ABC transporter permease  63.19 
 
 
374 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6205  ABC-2 type transporter  64.93 
 
 
374 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.261883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3854  ABC transporter ATP-binding protein  61.05 
 
 
374 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3777  ABC transporter ATP-binding protein  60.71 
 
 
374 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439357  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3897  ABC transporter ATP-binding protein  60.77 
 
 
374 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3787  ABC transporter, ATP-binding protein  61.05 
 
 
374 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3957  ABC transporter ATP-binding protein  61.05 
 
 
374 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03335  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  59.73 
 
 
374 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0229  ABC-2 type transporter  59.73 
 
 
374 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3774  ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 
374 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03287  hypothetical protein  59.73 
 
 
374 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3967  ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 
374 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3837  ABC transporter, ATP-binding protein  59.73 
 
 
374 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0230  ABC-2 type transporter  59.45 
 
 
374 aa  435  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3684  ABC transporter, ATP-binding protein  59.45 
 
 
374 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4830  ABC transporter, ATP-binding protein  59.73 
 
 
374 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1431  hypothetical protein  61.96 
 
 
371 aa  431  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5884  ABC-2 type transporter  64.66 
 
 
374 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0315  ABC-2 type transporter  64.31 
 
 
374 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  59.29 
 
 
374 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  56.4 
 
 
373 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1150  ABC-2 type transporter  58.56 
 
 
412 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.13202  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0811  ABC-2 type transporter  51.78 
 
 
375 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0019  ABC-2 type transporter  54.64 
 
 
373 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  49.86 
 
 
375 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3789  ABC-2 type transporter  50.82 
 
 
390 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7848  putative ABC transporter (permease protein)  53.02 
 
 
376 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00792305  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0566  ABC-2 type transporter  49.73 
 
 
399 aa  354  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222842  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0501  ABC-2 type transporter  49.73 
 
 
399 aa  354  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  49.04 
 
 
370 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  49.59 
 
 
370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  49.32 
 
 
370 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  51.09 
 
 
393 aa  352  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0537  ABC-2 type transporter  48.63 
 
 
398 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2949  ABC-2 type transporter  49.17 
 
 
382 aa  343  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1562  ABC-2 type transporter  47.11 
 
 
374 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.986622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5443  hypothetical protein  49.18 
 
 
372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889571 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1613  ABC-2 type transporter  46.69 
 
 
374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1742  ABC-2 type transporter  47.68 
 
 
401 aa  338  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00338931 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  49.73 
 
 
379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  48.48 
 
 
375 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0080  ABC-2 type transporter  48.77 
 
 
379 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0879828  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  45.05 
 
 
374 aa  322  7e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5749  ABC-2 type transporter  46.3 
 
 
375 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166668  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3879  ABC transporter  47.67 
 
 
350 aa  312  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3215  hypothetical protein  42.93 
 
 
374 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3157  ABC transporter, inner membrane subunit  42.12 
 
 
374 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00527406  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3895  ABC-2 type transporter  42.12 
 
 
374 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.505485  normal  0.0804287 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  33.97 
 
 
381 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 
372 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  28.61 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.71 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  28.53 
 
 
366 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  27.57 
 
 
376 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  29.01 
 
 
377 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 
368 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  29.19 
 
 
376 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 
379 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 
378 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  28.85 
 
 
369 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  28.12 
 
 
376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 
376 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 
378 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 
368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>