More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1238 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3423  C4-dicarboxylate transporter DctA  99.59 
 
 		 440 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329562  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2461  C4-dicarboxylate transporter DctA  99.59 
 
 		 440 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3460  C4-dicarboxylate transporter DctA  99.59 
 
 		 440 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3458  C4-dicarboxylate transporter DctA  99.59 
 
 		 440 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2649  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  100 
 
 		 241 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0379  C4-dicarboxylate transporter DctA  99.59 
 
 		 440 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1238  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  100 
 
 		 241 aa  474  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1203  C4-dicarboxylate transporter DctA  94.19 
 
 		 440 aa  418  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2740  C4-dicarboxylate transporter DctA  85.89 
 
 		 452 aa  407  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0765011  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3732  C4-dicarboxylate transporter DctA  86.72 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0613  C4-dicarboxylate transporter DctA  85.6 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0163  C4-dicarboxylate transporter DctA  85.6 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0646  C4-dicarboxylate transporter DctA  85.6 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0568  C4-dicarboxylate transporter DctA  85.12 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3388  C4-dicarboxylate transporter DctA  85.54 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001363 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0541  C4-dicarboxylate transporter DctA  85.06 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0508551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0567  C4-dicarboxylate transporter DctA  85.06 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245555  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2596  C4-dicarboxylate transporter DctA  87.34 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3444  C4-dicarboxylate transporter DctA  70.59 
 
 		 467 aa  333  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1420  C4-dicarboxylate transporter DctA  69.53 
 
 		 443 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3279  C4-dicarboxylate transporter DctA  75 
 
 		 463 aa  329  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3012  C4-dicarboxylate transporter DctA  72.48 
 
 		 436 aa  323  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.723105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01460  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.81 
 
 		 449 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.881945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0554  C4-dicarboxylate transporter DctA  71.23 
 
 		 435 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0194  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.53 
 
 		 444 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247995  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3146  C4-dicarboxylate transporter DctA  67.36 
 
 		 446 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3275  C4-dicarboxylate transporter DctA  71.86 
 
 		 446 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.292333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4324  C4-dicarboxylate transporter DctA  70.4 
 
 		 438 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.269388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3956  C4-dicarboxylate transporter DctA  70.4 
 
 		 438 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4433  C4-dicarboxylate transporter DctA  72.22 
 
 		 438 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1886  C4-dicarboxylate transporter DctA  69.13 
 
 		 437 aa  309  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3483  C4-dicarboxylate transporter DctA  69.13 
 
 		 436 aa  308  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.225944  normal  0.530275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4878  C4-dicarboxylate transporter DctA  67.23 
 
 		 437 aa  308  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3085  C4-dicarboxylate transporter DctA  73.48 
 
 		 440 aa  308  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2255  C4-dicarboxylate transporter DctA  69.43 
 
 		 436 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.16569  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3473  C4-dicarboxylate transporter DctA  68.18 
 
 		 446 aa  308  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1101  C4-dicarboxylate transporter DctA  70.18 
 
 		 425 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1729  C4-dicarboxylate transporter DctA  67.83 
 
 		 436 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4368  C4-dicarboxylate transporter DctA  72.94 
 
 		 441 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3948  C4-dicarboxylate transporter DctA  67.25 
 
 		 442 aa  302  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5335  C4-dicarboxylate transporter DctA  72.89 
 
 		 443 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0237  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.81 
 
 		 447 aa  300  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0307  C4-dicarboxylate transporter DctA  70.83 
 
 		 444 aa  291  6e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0796  C4-dicarboxylate transporter DctA  69.47 
 
 		 437 aa  291  7e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.86356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  58.33 
 
 		 437 aa  268  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  59.17 
 
 		 439 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  59.91 
 
 		 428 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  59.91 
 
 		 428 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  59.91 
 
 		 428 aa  258  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.91 
 
 		 428 aa  258  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.91 
 
 		 428 aa  258  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.91 
 
 		 428 aa  258  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.91 
 
 		 428 aa  258  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  57.8 
 
 		 439 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.91 
 
 		 428 aa  258  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.62 
 
 		 465 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.45 
 
 		 428 aa  257  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.92 
 
 		 452 aa  256  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.19 
 
 		 448 aa  255  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.91 
 
 		 452 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.59 
 
 		 429 aa  251  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.42 
 
 		 436 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.08 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.99 
 
 		 428 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  55 
 
 		 436 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.99 
 
 		 428 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.99 
 
 		 428 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.99 
 
 		 428 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.99 
 
 		 428 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.14 
 
 		 444 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.6 
 
 		 447 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.59 
 
 		 428 aa  248  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.39 
 
 		 440 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  58.06 
 
 		 442 aa  248  8e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.8 
 
 		 440 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.29 
 
 		 440 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.29 
 
 		 440 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.34 
 
 		 428 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.72 
 
 		 429 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.21 
 
 		 450 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.72 
 
 		 429 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.06 
 
 		 442 aa  245  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.72 
 
 		 429 aa  246  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  59.81 
 
 		 460 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  56 
 
 		 443 aa  245  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.17 
 
 		 451 aa  244  8e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.07 
 
 		 430 aa  243  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.85 
 
 		 447 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  53.3 
 
 		 450 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1440  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.8 
 
 		 448 aa  242  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022063  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.83 
 
 		 430 aa  242  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  53.3 
 
 		 450 aa  241  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.39 
 
 		 430 aa  241  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.41 
 
 		 442 aa  241  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  55.05 
 
 		 444 aa  241  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.6 
 
 		 429 aa  241  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.63 
 
 		 444 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  54.38 
 
 		 447 aa  240  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.82 
 
 		 444 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  55.35 
 
 		 449 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>