More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_0166 on replicon NC_011775
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011775  BCG9842_0166  DNA topoisomerase III  100 
 
 
687 aa  1413    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  42.76 
 
 
714 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  40.53 
 
 
718 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1767  DNA topoisomerase III  42.59 
 
 
714 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.258845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1744  DNA topoisomerase III  42.59 
 
 
714 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1725  DNA topoisomerase III  42.59 
 
 
714 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1940  DNA topoisomerase III  42.59 
 
 
714 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08242e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1905  DNA topoisomerase III  42.59 
 
 
714 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000492134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3433  DNA topoisomerase III  42.59 
 
 
714 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000032124  hitchhiker  0.00000000499159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1984  DNA topoisomerase III  42.59 
 
 
714 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2011  DNA topoisomerase III  42.42 
 
 
714 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00587828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1911  DNA topoisomerase III  42.42 
 
 
714 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  35.44 
 
 
799 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  35.64 
 
 
689 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1472  DNA topoisomerase III  41.61 
 
 
714 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000939771  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  33.9 
 
 
701 aa  350  5e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0072  DNA topoisomerase  34.81 
 
 
720 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  34.51 
 
 
695 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5409  DNA topoisomerase III  35.08 
 
 
714 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  28.65 
 
 
867 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  33.33 
 
 
746 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  35.65 
 
 
722 aa  298  3e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  30.04 
 
 
839 aa  295  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  29.44 
 
 
869 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  29.44 
 
 
869 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  29.44 
 
 
869 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  29.44 
 
 
869 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  29.44 
 
 
869 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  29.44 
 
 
869 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  29.86 
 
 
888 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  29.44 
 
 
906 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  29.71 
 
 
889 aa  290  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  29.31 
 
 
891 aa  289  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  28.89 
 
 
865 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  29.03 
 
 
865 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  28.89 
 
 
865 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  28.89 
 
 
865 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  28.59 
 
 
865 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  28.89 
 
 
865 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  33.27 
 
 
729 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  28.59 
 
 
865 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  30.34 
 
 
846 aa  282  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  28.11 
 
 
920 aa  281  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  28.91 
 
 
908 aa  281  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  29.67 
 
 
975 aa  279  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  30.19 
 
 
891 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  28.22 
 
 
876 aa  278  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  28.57 
 
 
854 aa  278  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  30.69 
 
 
754 aa  276  9e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  29.33 
 
 
877 aa  274  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  29.19 
 
 
876 aa  274  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0093  topoisomerase IA  30.54 
 
 
722 aa  274  4.0000000000000004e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  29.19 
 
 
876 aa  273  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  28.71 
 
 
982 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  28.69 
 
 
876 aa  269  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1737  DNA topoisomerase III  31.37 
 
 
676 aa  269  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  28.43 
 
 
981 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  28.43 
 
 
981 aa  267  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  29.93 
 
 
896 aa  267  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  28.37 
 
 
980 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  33.14 
 
 
729 aa  265  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  27.67 
 
 
1002 aa  265  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  28.75 
 
 
990 aa  265  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  28.18 
 
 
939 aa  263  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  28.57 
 
 
768 aa  263  6.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0033  putative DNA topoisomerase III  29.12 
 
 
815 aa  263  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  30.81 
 
 
680 aa  263  8.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  27.27 
 
 
920 aa  261  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  32.38 
 
 
729 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  32.63 
 
 
731 aa  260  6e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  32.88 
 
 
731 aa  260  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  31.92 
 
 
744 aa  259  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  32.57 
 
 
729 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  28.92 
 
 
879 aa  258  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  32.38 
 
 
729 aa  256  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3236  DNA topoisomerase  29.53 
 
 
777 aa  256  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  32.38 
 
 
729 aa  256  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  32.38 
 
 
729 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  32.38 
 
 
729 aa  256  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  32.38 
 
 
729 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  30.5 
 
 
669 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  32.18 
 
 
729 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  29.04 
 
 
655 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  33.27 
 
 
721 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  32.18 
 
 
729 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  29.06 
 
 
671 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  28.49 
 
 
992 aa  253  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  32.18 
 
 
729 aa  253  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  28.93 
 
 
671 aa  252  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3624  DNA topoisomerase III  31.85 
 
 
652 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203006  normal  0.930533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1814  DNA topoisomerase III  31.85 
 
 
653 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230615  normal  0.182925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3423  DNA topoisomerase III  31.65 
 
 
654 aa  250  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4019  DNA topoisomerase III  31.85 
 
 
653 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  29.64 
 
 
670 aa  249  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3364  DNA topoisomerase III  31.71 
 
 
647 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27190  DNA topoisomerase III  31.78 
 
 
650 aa  249  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  27.41 
 
 
851 aa  248  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  28.62 
 
 
671 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0898  DNA topoisomerase III  26.66 
 
 
869 aa  247  6e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  28.75 
 
 
670 aa  246  9e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>