More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_1007 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  100 
 
 
183 aa  379  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  92.35 
 
 
183 aa  355  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  45.4 
 
 
190 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  47.62 
 
 
180 aa  148  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  46.51 
 
 
180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  47.62 
 
 
180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  47.02 
 
 
180 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  46.43 
 
 
180 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  47.62 
 
 
180 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  40.66 
 
 
190 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  42.22 
 
 
190 aa  140  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  42.55 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  43.18 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  42.05 
 
 
190 aa  136  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  43.45 
 
 
180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  42.62 
 
 
182 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  42.44 
 
 
180 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  42.86 
 
 
180 aa  131  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  42.22 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  42.13 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  45.77 
 
 
169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  42.86 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  44.69 
 
 
187 aa  124  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  42.26 
 
 
180 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  40 
 
 
189 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  40.35 
 
 
182 aa  120  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  41.57 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  37.84 
 
 
188 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  36.76 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  36.21 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  39.44 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  36.76 
 
 
188 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  36.76 
 
 
188 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  36.76 
 
 
188 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  36.76 
 
 
188 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  36.22 
 
 
188 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  34.48 
 
 
176 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  34.48 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  35.68 
 
 
188 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  38.98 
 
 
186 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  35.06 
 
 
179 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  35.06 
 
 
179 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  35.06 
 
 
176 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  35.06 
 
 
176 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  35.06 
 
 
176 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  35.06 
 
 
176 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  35.06 
 
 
176 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  35.06 
 
 
176 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  35.68 
 
 
188 aa  104  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  35.68 
 
 
188 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0644  phage integrase family protein  34.66 
 
 
186 aa  95.5  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0659  phage integrase family protein  34.66 
 
 
186 aa  95.5  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.271524  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  32.78 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  31.84 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  31.84 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  31.58 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 
319 aa  78.2  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0439  phage integrase, C-terminus  58.62 
 
 
73 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264159  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  34.72 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  29.53 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  31.25 
 
 
284 aa  72  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  32.88 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0438  phage integrase, N-terminus  42.42 
 
 
97 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0989457  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  28.81 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  32.19 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  32.21 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  32.21 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  29.66 
 
 
295 aa  68.6  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  29.78 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  32.97 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  28.14 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  26.62 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  28.03 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  26.62 
 
 
292 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  26.62 
 
 
292 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  26.62 
 
 
292 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
328 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
332 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  25.69 
 
 
295 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
328 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  27.92 
 
 
290 aa  63.2  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3891  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.89 
 
 
317 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125291  decreased coverage  0.00274094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  27.38 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  32.61 
 
 
354 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  27.92 
 
 
290 aa  63.2  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  27.68 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  26.8 
 
 
302 aa  62.8  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.37 
 
 
313 aa  62  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  25.28 
 
 
207 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  28.06 
 
 
312 aa  61.6  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  26.75 
 
 
291 aa  61.2  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2717  hypothetical protein  24.85 
 
 
169 aa  60.8  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  21.23 
 
 
292 aa  60.5  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3598  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.21 
 
 
317 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  24.11 
 
 
304 aa  60.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  24.56 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  25.28 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 
295 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  28.67 
 
 
283 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2172  tyrosine recombinase XerD  26.47 
 
 
309 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.178894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>