51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0197 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  68.62 
 
 		 635 aa  798    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  65.96 
 
 		 594 aa  758    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  63.02 
 
 		 632 aa  733    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  60.25 
 
 		 632 aa  716    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  62.48 
 
 		 641 aa  714    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  100 
 
 		 584 aa  1211    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  65.91 
 
 		 639 aa  797    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  67.34 
 
 		 612 aa  791    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  58.42 
 
 		 627 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  58.42 
 
 		 627 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  53.04 
 
 		 614 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  52.21 
 
 		 559 aa  570  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  47.36 
 
 		 791 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  47.82 
 
 		 771 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  44.08 
 
 		 754 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  46.46 
 
 		 782 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  47.94 
 
 		 727 aa  458  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  45.12 
 
 		 781 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  47.69 
 
 		 739 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  43.72 
 
 		 786 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  42.93 
 
 		 761 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  48.33 
 
 		 543 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  41.53 
 
 		 742 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  45.6 
 
 		 769 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  41.39 
 
 		 752 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  41.39 
 
 		 752 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  42.7 
 
 		 834 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  42.83 
 
 		 723 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  44.91 
 
 		 792 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  42.18 
 
 		 819 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  43.43 
 
 		 742 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  41.73 
 
 		 723 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  41.83 
 
 		 785 aa  422  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  41.27 
 
 		 746 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  44.04 
 
 		 914 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  41.62 
 
 		 788 aa  415  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  42.26 
 
 		 771 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  37.74 
 
 		 754 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  26.01 
 
 		 375 aa  88.6  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  29.11 
 
 		 372 aa  72  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  27.27 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  25.77 
 
 		 373 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  25.77 
 
 		 373 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  27.1 
 
 		 373 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  36.46 
 
 		 176 aa  62.4  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  25.47 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2485  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 363 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0293375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.23 
 
 		 366 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2415  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.91 
 
 		 355 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00432612  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5780  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 		 369 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.390306  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23630  PHB synthase  22.74 
 
 		 567 aa  44.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>