42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7690 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  60.04 
 
 		 932 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  68.68 
 
 		 926 aa  787    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  100 
 
 		 622 aa  1296    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  58.44 
 
 		 928 aa  654    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  61.05 
 
 		 928 aa  670    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  60.96 
 
 		 918 aa  673    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  58.29 
 
 		 926 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  52.44 
 
 		 921 aa  549  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  47.56 
 
 		 909 aa  481  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  41.49 
 
 		 929 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  33.93 
 
 		 912 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  34.3 
 
 		 916 aa  319  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  34.25 
 
 		 914 aa  306  9.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  33.45 
 
 		 871 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  33.4 
 
 		 937 aa  289  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  31.96 
 
 		 908 aa  277  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  31.33 
 
 		 933 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  32.84 
 
 		 919 aa  262  2e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  31.72 
 
 		 941 aa  249  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  30.71 
 
 		 928 aa  247  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  29.82 
 
 		 934 aa  247  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  31.72 
 
 		 909 aa  229  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  29.08 
 
 		 929 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  27.92 
 
 		 934 aa  211  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  27.12 
 
 		 955 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0349  hypothetical protein  82.35 
 
 		 115 aa  91.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270538  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  35.29 
 
 		 97 aa  65.1  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1365 aa  63.9  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  24.27 
 
 		 978 aa  61.6  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1347 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1347 aa  57.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1363 aa  57.4  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1282 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1339 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1339 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1346 aa  54.3  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  21.6 
 
 		 1353 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1342 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  20.75 
 
 		 1151 aa  51.6  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  21.14 
 
 		 1188 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  20.27 
 
 		 536 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1290 aa  43.5  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>