62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7509 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  100 
 
 		 107 aa  220  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  35.64 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2896  hypothetical protein  37.63 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2773  hypothetical protein  34.26 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4398  hypothetical protein  32.94 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3000  hypothetical protein  32.41 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0511761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  33.66 
 
 		 230 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  29.76 
 
 		 352 aa  53.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  35.44 
 
 		 124 aa  50.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  28.3 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  29.63 
 
 		 223 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0558  hypothetical protein  39.68 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  32.61 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  30.86 
 
 		 193 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  36.11 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  31.51 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  34.04 
 
 		 240 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  28.57 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  34.15 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  29.73 
 
 		 444 aa  45.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  30.86 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  29.17 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  31.65 
 
 		 223 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  31.94 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  28.85 
 
 		 220 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  30.38 
 
 		 218 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  34.25 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  35.62 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  30.95 
 
 		 264 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  31.65 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  31.65 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  31.65 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  31.65 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  36.49 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3424  hypothetical protein  36.84 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185141  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0004  hypothetical protein  27.71 
 
 		 298 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  32.35 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  30.17 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  30.38 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0060  hypothetical protein  30.39 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1216  hypothetical protein  30.39 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1499  hypothetical protein  30.39 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0072  hypothetical protein  30.39 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  32.88 
 
 		 120 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  30.69 
 
 		 113 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  31.33 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1566  plastocyanin/azurin family copper binding protein  28.57 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  31.87 
 
 		 486 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  29.47 
 
 		 246 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0071  plastocyanin/azurin family copper binding protein  28.05 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0088  plastocyanin/azurin family copper binding protein  28.05 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  29.25 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  29.25 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  31.91 
 
 		 223 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  32.94 
 
 		 119 aa  40  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  33.03 
 
 		 192 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>