96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4065 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  100 
 
 		 336 aa  680    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  48.87 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  48.87 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  48.87 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  46.11 
 
 		 318 aa  258  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  44.86 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  44.54 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  42.36 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  43.75 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  40.94 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  29.39 
 
 		 476 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  34.32 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  32.66 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  29.86 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  31.36 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  31 
 
 		 348 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  30.63 
 
 		 348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  30.26 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  31.36 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  29.31 
 
 		 374 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  28.75 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  29.14 
 
 		 334 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  28.94 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  30.22 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  29.52 
 
 		 372 aa  90.1  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  28.73 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  28.87 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  28.09 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  31.36 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  26.27 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  25.36 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  30.34 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  27.94 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  27.35 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  32.61 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  29 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  38.84 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  26.85 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  31.89 
 
 		 607 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  29.73 
 
 		 568 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  31.89 
 
 		 551 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  31.29 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  31.67 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  28.96 
 
 		 547 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  28.41 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  28.09 
 
 		 567 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  27.96 
 
 		 567 aa  62.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  29.12 
 
 		 543 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  26.24 
 
 		 572 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  27.96 
 
 		 545 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  26.73 
 
 		 572 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  35.71 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  26.98 
 
 		 601 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  26.46 
 
 		 569 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  30.71 
 
 		 568 aa  57  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  26.13 
 
 		 533 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  26.12 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  27.05 
 
 		 343 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  26.5 
 
 		 570 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  25.42 
 
 		 565 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  26.11 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.08 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  27.69 
 
 		 605 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  30.05 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  26.7 
 
 		 600 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  26.7 
 
 		 600 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  32.58 
 
 		 449 aa  49.7  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  30.97 
 
 		 433 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  34.69 
 
 		 302 aa  49.7  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  22.38 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  29.17 
 
 		 542 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  33.07 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  25.75 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  35.38 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  28.81 
 
 		 430 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  26.77 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  26.96 
 
 		 369 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  34.21 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  26.47 
 
 		 369 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  28.39 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.76 
 
 		 488 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.21 
 
 		 659 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.13 
 
 		 706 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  28.37 
 
 		 399 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  22.84 
 
 		 571 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.89 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  26.21 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1021  hypothetical protein  33.07 
 
 		 389 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  28.08 
 
 		 653 aa  43.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2202  dienelactone hydrolase  30.43 
 
 		 528 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.413126  decreased coverage  0.0031404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  33.04 
 
 		 968 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.59 
 
 		 649 aa  43.1  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  30 
 
 		 324 aa  43.1  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  26.61 
 
 		 498 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  31.73 
 
 		 248 aa  42.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  26.39 
 
 		 468 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>