More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3114 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02283  hypothetical protein  60.14 
 
 		 564 aa  663    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1284  oxalyl-CoA decarboxylase  60.14 
 
 		 564 aa  663    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2510  putative oxalyl-CoA decarboxylase  60.14 
 
 		 564 aa  663    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.397201  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5585  putative oxalyl-CoA decarboxylase  79.03 
 
 		 581 aa  954    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0637  putative oxalyl-CoA decarboxylase  68.09 
 
 		 569 aa  804    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1369  putative oxalyl-CoA decarboxylase  80.14 
 
 		 583 aa  916    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2523  putative oxalyl-CoA decarboxylase  59.78 
 
 		 564 aa  672    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4664  putative oxalyl-CoA decarboxylase  73.14 
 
 		 577 aa  850    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4056  putative oxalyl-CoA decarboxylase  80.59 
 
 		 601 aa  914    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02244  hypothetical protein  60.14 
 
 		 564 aa  663    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2502  putative oxalyl-CoA decarboxylase  70.95 
 
 		 581 aa  830    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10119  putative oxalyl-CoA decarboxylase  58.94 
 
 		 582 aa  647    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1209  putative oxalyl-CoA decarboxylase  80.14 
 
 		 583 aa  916    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4487  putative oxalyl-CoA decarboxylase  73.9 
 
 		 609 aa  863    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6740  putative oxalyl-CoA decarboxylase  70.28 
 
 		 580 aa  822    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.766112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3114  putative oxalyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 576 aa  1178    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.857507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2661  putative oxalyl-CoA decarboxylase  59.96 
 
 		 564 aa  661    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1296  putative oxalyl-CoA decarboxylase  60.14 
 
 		 564 aa  663    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2800  putative oxalyl-CoA decarboxylase  74.47 
 
 		 576 aa  862    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193882  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2759  putative oxalyl-CoA decarboxylase  70.28 
 
 		 580 aa  838    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2742  putative oxalyl-CoA decarboxylase  59.96 
 
 		 564 aa  662    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0486  putative oxalyl-CoA decarboxylase  80.91 
 
 		 584 aa  948    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4838  putative oxalyl-CoA decarboxylase  81.18 
 
 		 598 aa  936    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3618  putative oxalyl-CoA decarboxylase  70.85 
 
 		 579 aa  812    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000526627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3605  putative oxalyl-CoA decarboxylase  60.14 
 
 		 564 aa  663    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1149  putative oxalyl-CoA decarboxylase  81.04 
 
 		 584 aa  925    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314848  normal  0.637283 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0248  putative oxalyl-CoA decarboxylase  53.41 
 
 		 578 aa  583  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0169011 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0494  putative oxalyl-CoA decarboxylase  52.06 
 
 		 576 aa  581  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000405368  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10214  2-hydroxyphytanoyl-CoA lyase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05230)  35.25 
 
 		 605 aa  352  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00157482  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  31.08 
 
 		 582 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  29.8 
 
 		 847 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.12 
 
 		 557 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  29.8 
 
 		 847 aa  220  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11850  hypothetical protein  29.18 
 
 		 547 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  28.26 
 
 		 550 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0553  hypothetical protein  30.61 
 
 		 553 aa  213  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000755623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.15 
 
 		 568 aa  209  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2914  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  28.97 
 
 		 548 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.540468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8313  putative acetolactate synthase  28.54 
 
 		 550 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1207  hypothetical protein  27.56 
 
 		 540 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1100  hypothetical protein  26.63 
 
 		 540 aa  197  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.575745  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5210  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.15 
 
 		 549 aa  197  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1710  hypothetical protein  30.4 
 
 		 551 aa  196  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  27.21 
 
 		 570 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.12 
 
 		 581 aa  194  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.44 
 
 		 552 aa  194  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7728  hypothetical protein  28.34 
 
 		 559 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.76 
 
 		 581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.04 
 
 		 568 aa  190  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  26.25 
 
 		 578 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.75 
 
 		 563 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.48 
 
 		 561 aa  189  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.45 
 
 		 582 aa  188  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  26.94 
 
 		 587 aa  187  6e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1909  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  27.69 
 
 		 561 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000425472  hitchhiker  0.0000717525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.86 
 
 		 619 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.32 
 
 		 587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  26.52 
 
 		 587 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1796  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  26.32 
 
 		 571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.98 
 
 		 573 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363246 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18810  acetolactate synthase, large subunit  27.3 
 
 		 585 aa  184  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.740593  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3698  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.02 
 
 		 568 aa  183  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.05 
 
 		 588 aa  183  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.1 
 
 		 612 aa  183  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  27.23 
 
 		 599 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.35 
 
 		 559 aa  183  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  28.39 
 
 		 562 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  25.27 
 
 		 640 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  28.65 
 
 		 562 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  25.35 
 
 		 576 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.14 
 
 		 579 aa  182  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2386  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.87 
 
 		 613 aa  182  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  28.32 
 
 		 565 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  28.78 
 
 		 562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.9 
 
 		 566 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  28.42 
 
 		 565 aa  181  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  26.77 
 
 		 587 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  28.6 
 
 		 562 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3715  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.31 
 
 		 568 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  28.2 
 
 		 565 aa  180  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13018  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  27.69 
 
 		 618 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0170383  normal  0.298126 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  27.07 
 
 		 587 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4777  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  25.35 
 
 		 571 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  28.47 
 
 		 562 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  28.47 
 
 		 562 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4396  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  25.35 
 
 		 571 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.4 
 
 		 557 aa  179  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  28.47 
 
 		 562 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4483  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.35 
 
 		 571 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.714165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.85 
 
 		 563 aa  176  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0544  acetolactate synthase-like TPP-requiring enzyme  27.29 
 
 		 586 aa  176  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261466 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.05 
 
 		 565 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.08 
 
 		 566 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  25.23 
 
 		 542 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  26.94 
 
 		 577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  27.73 
 
 		 597 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  26.06 
 
 		 547 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  27.09 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.91 
 
 		 566 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.52 
 
 		 592 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>