More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1907 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1907  ABC transporter permease  100 
 
 
296 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.84 
 
 
273 aa  318  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.72 
 
 
273 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193296  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6275  ABC transporter membrane spanning protein (spermidine/putrescine)  57.46 
 
 
272 aa  305  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3335  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  56.82 
 
 
278 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.44 
 
 
278 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137832  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.3 
 
 
278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.189736  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.93 
 
 
294 aa  275  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0399533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1359  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818924  normal  0.0399312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.66 
 
 
301 aa  269  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.24 
 
 
296 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.34 
 
 
295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2891  ABC transporter permease  48.14 
 
 
300 aa  265  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.05 
 
 
298 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.95 
 
 
297 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.83 
 
 
294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547475  hitchhiker  0.001025 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7131  ABC transporter membrane spanning protein (spermidine/putrescine)  47.25 
 
 
281 aa  252  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.67 
 
 
298 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.52 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.226499  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3372  ABC transporter permease protein  45.19 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.08 
 
 
294 aa  225  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.869934  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5876  ABC transporter membrane spanning protein (spermidine/putrescine)  36.73 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  32.44 
 
 
266 aa  122  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 
266 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 
266 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.84 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.84 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  29.84 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  29.84 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  29.84 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  29.84 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  30.53 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8149  ABC transporter  34.85 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181021  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  30.74 
 
 
287 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1063  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  31.62 
 
 
258 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000694719  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.9 
 
 
274 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.026759  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  30.45 
 
 
284 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  30.23 
 
 
266 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
275 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360042  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.21 
 
 
269 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747095  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  29.02 
 
 
256 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  29.02 
 
 
256 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
260 aa  100  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  31.08 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  33.33 
 
 
256 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3012  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.3 
 
 
267 aa  99  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.343858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  33.33 
 
 
256 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0343  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.88 
 
 
256 aa  99  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
275 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
275 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0750  ABC transporter permease  31.36 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
277 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3109  spermidine/putrescine ABC transporter permease  31.62 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
275 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.355956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1221  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
268 aa  96.7  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.77 
 
 
279 aa  95.9  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.07 
 
 
276 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
275 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.776443 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.8 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4294  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144254  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07900  putative permease of ABC transporter  30.93 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280578 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1261  Ornithine carbamoyltransferase  29.82 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.586316  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
279 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576146  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
261 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1598  inner membrane ABC-transporter permease protein  29.92 
 
 
268 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131611  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  29.04 
 
 
273 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
268 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.466236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
268 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.607638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0283  polyamine ABC-transporter, inner membrane subunit  28.47 
 
 
274 aa  92.4  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.463421  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
278 aa  92.4  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  0.45751 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
272 aa  92.4  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
272 aa  92  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
259 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  28.09 
 
 
285 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.13 
 
 
272 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395984  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.38 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0922779  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.77 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.26536  normal  0.0890799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.38 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326654  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2609  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.38 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00123252  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  31.43 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
264 aa  90.1  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0148885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3243  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.78 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  31.17 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28 
 
 
284 aa  89  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446798  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5840  ABC transporter membrane spanning protein (putrescine)  29.73 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  30.54 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3606  Ornithine carbamoyltransferase  28.06 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>