59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1202 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  100 
 
 		 266 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  84.21 
 
 		 268 aa  449  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  57.63 
 
 		 293 aa  311  7.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  55.51 
 
 		 301 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.77 
 
 		 284 aa  188  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.29 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.82 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.16 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  33.2 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  35.38 
 
 		 306 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  36.86 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  34.51 
 
 		 300 aa  152  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  35.04 
 
 		 314 aa  151  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  33.58 
 
 		 302 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  34.41 
 
 		 306 aa  148  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  31.78 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  35.51 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  35.56 
 
 		 303 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  32.54 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  32.06 
 
 		 332 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  34.24 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  35.54 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  35.39 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  35.39 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  35.04 
 
 		 304 aa  135  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  32.14 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  30.5 
 
 		 311 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.26 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.97 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.97 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.82 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.24 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  26.41 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.17 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  23.42 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.56 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.06 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.07 
 
 		 293 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.95 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.43 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.03 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  27.2 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.66 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.64 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3783  hypothetical protein  24.63 
 
 		 311 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  22.54 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.21 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6528  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  26.95 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.6 
 
 		 230 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.78 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.78 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.48 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.54 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  23.79 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3622  hypothetical protein  27.57 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  23.47 
 
 		 268 aa  42.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>