177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0748 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 
267 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  74.12 
 
 
273 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  71.81 
 
 
273 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  71.65 
 
 
273 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  68.21 
 
 
176 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  54.15 
 
 
277 aa  248  5e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  49.03 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  50.81 
 
 
270 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  48.21 
 
 
284 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  49.39 
 
 
287 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  46.22 
 
 
284 aa  222  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  46.56 
 
 
271 aa  218  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  46.59 
 
 
282 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  45.14 
 
 
271 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  44.49 
 
 
267 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  42.57 
 
 
257 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  41.92 
 
 
276 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  46.4 
 
 
258 aa  201  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  43.5 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  44.26 
 
 
271 aa  198  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  43.37 
 
 
271 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  42.19 
 
 
271 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  41.77 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  36.28 
 
 
279 aa  142  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  34.22 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  34.22 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
275 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.19 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  31.36 
 
 
390 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  31.36 
 
 
277 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  31.36 
 
 
277 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  33.19 
 
 
286 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  31.54 
 
 
277 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  33.48 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  33.48 
 
 
285 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
280 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
265 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
265 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 
288 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
259 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
301 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  29.37 
 
 
296 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  31.05 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  29.44 
 
 
387 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
296 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
312 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  29.41 
 
 
387 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  25.35 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  24.81 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  30.52 
 
 
387 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
276 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  38.79 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  22.96 
 
 
312 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
284 aa  52.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.51 
 
 
369 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 
276 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 
363 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 
387 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1333  alpha/beta fold family hydrolase  29.67 
 
 
301 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0316  alpha/beta fold family hydrolase  29.67 
 
 
301 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0592  alpha/beta fold family hydrolase  29.67 
 
 
301 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0975  alpha/beta fold family hydrolase  29.67 
 
 
301 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  22.56 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
324 aa  49.3  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
276 aa  49.3  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  26.88 
 
 
280 aa  49.3  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  25.58 
 
 
257 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
273 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
273 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 
284 aa  48.9  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1237  alpha/beta fold family hydrolase  29.27 
 
 
301 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  21.48 
 
 
265 aa  48.9  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2497  alpha/beta fold family hydrolase  28.92 
 
 
301 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  22.65 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  24.63 
 
 
456 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 
324 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  31.38 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  23.22 
 
 
324 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  22.69 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.1 
 
 
562 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  24.64 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  25.82 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>