64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39930 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  715    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.86 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.87 
 
 		 352 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.58 
 
 		 350 aa  325  8.000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  46.96 
 
 		 375 aa  295  7e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  42.18 
 
 		 356 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.82 
 
 		 351 aa  294  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  44.57 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  42.98 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.66 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.51 
 
 		 375 aa  279  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.79 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.58 
 
 		 213 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.2 
 
 		 354 aa  212  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 		 354 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.17 
 
 		 353 aa  209  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.77 
 
 		 368 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.61 
 
 		 353 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.22 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.76 
 
 		 353 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 		 373 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.91 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  36.46 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.1 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.75 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  36.46 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  36.67 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.93 
 
 		 353 aa  185  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.83 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  34.82 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  37.97 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.11 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 		 376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  28.02 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  27.75 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 437 aa  115  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.569439 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05289  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00191099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1800  oxidoreductase Rmd  26.01 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0661573 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12941  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.78 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0139899  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2301  hypothetical protein  37.5 
 
 		 78 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.181563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 329 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 315 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 		 319 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.85 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.329803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.08 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.56 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0684  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.93 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.08 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  26.1 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03477  hypothetical protein  29.32 
 
 		 274 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000507754  normal  0.0546507 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 297 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 		 319 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0670  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 310 aa  43.1  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125394  normal  0.553916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>