More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_34840 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4659  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  82.86 
 
 		 596 aa  914    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.265445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1760  ABC transporter ATP-binding protein  82.43 
 
 		 610 aa  934    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 595 aa  1171    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1736  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  80 
 
 		 608 aa  888    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3656  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  80.2 
 
 		 608 aa  917    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0881594  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4088  ABC transporter-like  83.53 
 
 		 605 aa  957    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1367  ABC transporter related  82.37 
 
 		 610 aa  911    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3954  ABC transporter related  82.43 
 
 		 610 aa  933    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53150  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  82.35 
 
 		 596 aa  909    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1351  ABC transporter related  82.63 
 
 		 610 aa  939    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1695  ABC transporter related  86.05 
 
 		 593 aa  966    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1107  ABC transporter, ATP-binding protein  54.59 
 
 		 610 aa  631  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586381  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1541  ABC transporter ATP-binding protein  53.91 
 
 		 597 aa  633  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02349  ABC transporter, ATP-binding protein  52.86 
 
 		 598 aa  618  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2816  ABC transporter ATPase  57.88 
 
 		 588 aa  615  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.372787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0721  ABC transporter related  51.63 
 
 		 621 aa  591  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.787703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003428  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  52.63 
 
 		 554 aa  586  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000488495  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0885  ABC transporter related protein  41.05 
 
 		 590 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0069  ABC transporter-related protein  38.36 
 
 		 589 aa  444  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.590448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.62 
 
 		 583 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.15 
 
 		 587 aa  268  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  28.05 
 
 		 607 aa  265  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.47 
 
 		 628 aa  263  8e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.98 
 
 		 585 aa  260  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  33.99 
 
 		 582 aa  260  6e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.5 
 
 		 579 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.27 
 
 		 571 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  31.32 
 
 		 641 aa  258  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.56 
 
 		 587 aa  258  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.28 
 
 		 594 aa  258  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  32.25 
 
 		 639 aa  257  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  29.51 
 
 		 651 aa  257  4e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.8 
 
 		 571 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  33.6 
 
 		 578 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.91 
 
 		 571 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.91 
 
 		 571 aa  256  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.91 
 
 		 571 aa  256  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2515  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.13 
 
 		 587 aa  256  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  30.43 
 
 		 618 aa  256  9e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.47 
 
 		 571 aa  256  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.47 
 
 		 571 aa  256  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.28 
 
 		 572 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.25 
 
 		 618 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33 
 
 		 590 aa  254  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  33.66 
 
 		 627 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.99 
 
 		 590 aa  253  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 623 aa  253  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  32.63 
 
 		 596 aa  253  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  29.73 
 
 		 571 aa  253  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1982  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.71 
 
 		 594 aa  252  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.73 
 
 		 571 aa  253  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  30.96 
 
 		 584 aa  252  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.33 
 
 		 577 aa  252  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.73 
 
 		 571 aa  252  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  34.34 
 
 		 575 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.54 
 
 		 586 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  33.39 
 
 		 590 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.08 
 
 		 622 aa  250  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.23 
 
 		 594 aa  250  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.39 
 
 		 590 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.14 
 
 		 596 aa  249  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  31.03 
 
 		 583 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.85 
 
 		 609 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.19 
 
 		 586 aa  249  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.68 
 
 		 574 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.68 
 
 		 575 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.68 
 
 		 575 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.68 
 
 		 575 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.68 
 
 		 574 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  32.45 
 
 		 582 aa  249  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  31.31 
 
 		 636 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.68 
 
 		 596 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.68 
 
 		 596 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  30.6 
 
 		 586 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  31.85 
 
 		 610 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  30.2 
 
 		 573 aa  248  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  31.61 
 
 		 586 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  29.83 
 
 		 614 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0207  ABC transporter related  33.21 
 
 		 602 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.361271  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.97 
 
 		 590 aa  248  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  30.94 
 
 		 627 aa  247  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.48 
 
 		 587 aa  248  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  32.15 
 
 		 626 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  31.97 
 
 		 764 aa  248  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.54 
 
 		 580 aa  247  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  32.37 
 
 		 687 aa  247  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  28.31 
 
 		 597 aa  247  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  33.44 
 
 		 611 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.47 
 
 		 614 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.7 
 
 		 586 aa  246  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.7 
 
 		 586 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01193  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.55 
 
 		 589 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.02 
 
 		 587 aa  246  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  32.1 
 
 		 627 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  32.1 
 
 		 627 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.86 
 
 		 580 aa  246  6.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.49 
 
 		 677 aa  246  9e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  30.48 
 
 		 578 aa  246  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>