More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00860 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_00860  zinc ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 262 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.952452  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  84.67 
 
 		 262 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  85.82 
 
 		 262 aa  384  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  85.38 
 
 		 262 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  86.21 
 
 		 262 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  84.23 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  84.23 
 
 		 262 aa  367  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  86.15 
 
 		 260 aa  362  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  86.15 
 
 		 260 aa  361  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  85.77 
 
 		 260 aa  360  9e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  85.77 
 
 		 260 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  65.45 
 
 		 263 aa  295  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  63.35 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  64.34 
 
 		 273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  61.33 
 
 		 261 aa  282  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  60.54 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  61.33 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  61.33 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2749  ABC-3 protein  68.28 
 
 		 266 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  62.3 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  61.33 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  61.33 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  60.94 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  61.9 
 
 		 261 aa  275  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  61.9 
 
 		 261 aa  275  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  60.94 
 
 		 261 aa  275  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  61.9 
 
 		 261 aa  275  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  61.9 
 
 		 261 aa  275  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  60.94 
 
 		 261 aa  275  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  62.03 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  61.51 
 
 		 261 aa  272  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  61.51 
 
 		 261 aa  272  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  63.89 
 
 		 270 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  59.3 
 
 		 271 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  58.91 
 
 		 271 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  60.78 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  59.77 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  59.16 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  50 
 
 		 261 aa  254  9e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  57.47 
 
 		 261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1669  zinc ABC transporter, permease protein  62.18 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1124  zinc ABC transporter, permease protein  56.69 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.750494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  59.22 
 
 		 261 aa  249  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  59.22 
 
 		 261 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  59.22 
 
 		 261 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2253  high-affinity zinc transporter membrane component  60.92 
 
 		 261 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4178  ABC-3 protein  55.6 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162455  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  57.63 
 
 		 261 aa  244  9e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2187  ABC transporter membrane spanning protein (zinc)  58.08 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  57.81 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1695  ABC-3 protein  58.66 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1727  ABC-3 protein  60.17 
 
 		 267 aa  239  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1029  zinc ABC transporter, permease protein  56.69 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4004  hypothetical protein  57.14 
 
 		 273 aa  225  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  48.26 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  49.43 
 
 		 268 aa  211  7.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0315  hypothetical protein  51.39 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0057  zinc transport system permease protein  52.38 
 
 		 262 aa  205  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3613  hypothetical protein  50.2 
 
 		 270 aa  198  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00635836 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3567  ABC zinc tranporter, inner membrane subunit ZnuB  53.31 
 
 		 260 aa  198  9e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3250  ABC-3 protein  53.31 
 
 		 260 aa  198  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.161789 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1701  putative high-affinity zinc uptake system membrane protein  52.71 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000503505  normal  0.0364016 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3154  hypothetical protein  51.65 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.87263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0190  hypothetical protein  52.48 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  39.27 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  33.98 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  36.54 
 
 		 280 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  35.41 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.95 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  36.82 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  34.36 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  36.92 
 
 		 277 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  35.71 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  30.52 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  36.9 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  34.58 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  29.57 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  30.89 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  36.51 
 
 		 272 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  34.32 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  32.82 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  38.55 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  35.11 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0858  ABC-3 protein  27.69 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0139094  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.92 
 
 		 279 aa  125  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  31.35 
 
 		 277 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  33.95 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  33.95 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  33.95 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  33.95 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  33.95 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  33.58 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  33.58 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0335  ABC-3 protein  33.58 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0205271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  33.95 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  33.58 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  33.59 
 
 		 277 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  36.65 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>