More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5625 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  29.48 
 
 		 2396 aa  780    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.08 
 
 		 2376 aa  793    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5625  polyketide synthase  100 
 
 		 2368 aa  4834    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2909  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  36.66 
 
 		 1946 aa  597  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3204  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  36.16 
 
 		 1937 aa  588  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.47814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2931  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  36.97 
 
 		 1981 aa  582  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.318285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1219  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  36.15 
 
 		 1985 aa  580  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2667  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  37.83 
 
 		 1928 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.448913  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1599  beta keto-acyl synthase  36.2 
 
 		 1963 aa  570  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2629  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  36.08 
 
 		 1979 aa  556  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2842  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  36.74 
 
 		 1989 aa  553  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4750  Beta-ketoacyl synthase  34.08 
 
 		 1605 aa  547  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1417  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  36.01 
 
 		 1998 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1451  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  34.85 
 
 		 1989 aa  543  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1421  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  35.03 
 
 		 1951 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1324  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  38.1 
 
 		 1985 aa  466  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.818863  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2735  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  38.26 
 
 		 1976 aa  466  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1423  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  37.55 
 
 		 1987 aa  467  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2668  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  38.19 
 
 		 1981 aa  463  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3324  Beta-ketoacyl synthase  28.09 
 
 		 2275 aa  450  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1686  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  34.35 
 
 		 1971 aa  451  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3102  polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  33.45 
 
 		 2016 aa  444  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  29.54 
 
 		 2276 aa  430  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.96 
 
 		 2348 aa  417  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3914  PfaB family protein  31.22 
 
 		 1107 aa  411  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.51111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  28.78 
 
 		 2391 aa  406  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2593  Beta-ketoacyl synthase  31.98 
 
 		 1109 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1113  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  37.87 
 
 		 1899 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.49 
 
 		 2336 aa  381  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0689  polyketide synthase modules and related proteins-like  30.28 
 
 		 3073 aa  371  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665216 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  30.67 
 
 		 2882 aa  355  8.999999999999999e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3953  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  35.02 
 
 		 775 aa  342  7e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0186337  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2930  Beta-hydroxyacyl dehydratase FabA/FabZ  35.76 
 
 		 987 aa  339  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000108157  normal  0.590292 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3915  beta-ketoacyl synthase  41.43 
 
 		 453 aa  335  5e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2592  Beta-ketoacyl synthase  40.76 
 
 		 453 aa  330  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4450  PfaB family protein  29.27 
 
 		 917 aa  322  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.562083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  35.45 
 
 		 1413 aa  233  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  32.99 
 
 		 1764 aa  226  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  35.33 
 
 		 1480 aa  222  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1672  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  31.75 
 
 		 3527 aa  220  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.55 
 
 		 2300 aa  217  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.48 
 
 		 1772 aa  215  7e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  32.46 
 
 		 2298 aa  209  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  32.97 
 
 		 1272 aa  208  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 		 2551 aa  207  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  32.84 
 
 		 3099 aa  206  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  33.12 
 
 		 2386 aa  206  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  43.77 
 
 		 6889 aa  206  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  33.18 
 
 		 3811 aa  205  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  33.77 
 
 		 2314 aa  204  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.54 
 
 		 2477 aa  203  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.3 
 
 		 2443 aa  202  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  35 
 
 		 2162 aa  201  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  32.66 
 
 		 1474 aa  201  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  40.07 
 
 		 1263 aa  201  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  41.48 
 
 		 1828 aa  201  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1024  beta-ketoacyl synthase  33.04 
 
 		 2053 aa  199  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  32.68 
 
 		 2327 aa  199  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  40.98 
 
 		 1580 aa  199  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  40.98 
 
 		 1580 aa  199  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  40.98 
 
 		 1580 aa  199  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4001  Beta-ketoacyl synthase  33.83 
 
 		 2000 aa  199  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  32.78 
 
 		 1453 aa  198  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  32.41 
 
 		 2448 aa  198  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  31.93 
 
 		 3194 aa  198  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  31.73 
 
 		 2642 aa  198  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.05 
 
 		 2661 aa  198  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1169  beta-ketoacyl synthase  33.55 
 
 		 1778 aa  198  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.51 
 
 		 2694 aa  197  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  30.87 
 
 		 4036 aa  197  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5640  beta-ketoacyl synthase  33.26 
 
 		 1840 aa  197  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.6 
 
 		 2771 aa  196  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  29.96 
 
 		 2620 aa  197  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.29 
 
 		 2704 aa  196  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  32.25 
 
 		 2664 aa  196  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.59 
 
 		 1939 aa  196  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.21 
 
 		 2414 aa  196  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  31.29 
 
 		 2703 aa  196  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4042  Beta-ketoacyl synthase  33.4 
 
 		 2036 aa  195  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  32.53 
 
 		 2619 aa  195  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  33.47 
 
 		 2674 aa  195  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  33.26 
 
 		 2531 aa  195  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  31.07 
 
 		 2693 aa  194  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  39.86 
 
 		 1876 aa  194  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6994  Beta-ketoacyl synthase  31.49 
 
 		 1276 aa  194  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13834  polyketide synthase pks13  31.8 
 
 		 1733 aa  194  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.924162 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  37.96 
 
 		 3780 aa  193  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  37.96 
 
 		 3781 aa  193  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  33.11 
 
 		 2439 aa  192  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  31.9 
 
 		 1656 aa  192  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  34.51 
 
 		 1835 aa  191  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  32.83 
 
 		 2624 aa  191  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  41.06 
 
 		 1823 aa  191  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  31.28 
 
 		 1587 aa  191  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  34.12 
 
 		 2880 aa  190  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3900  Beta-ketoacyl synthase, Acyl transferase subunit  33.12 
 
 		 1959 aa  191  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5606  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  32.75 
 
 		 2657 aa  190  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  32.75 
 
 		 2640 aa  190  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  31.18 
 
 		 1696 aa  190  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  42.21 
 
 		 2220 aa  189  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>