102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5238 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  810    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1794  hypothetical protein  58.77 
 
 		 407 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2340  hypothetical protein  43.29 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40083  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1385  hypothetical protein  43.16 
 
 		 385 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18972  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5828  hypothetical protein  43.16 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00482968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3893  twin-arginine translocation pathway signal  43.16 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4475  hypothetical protein  43.16 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3443  protein of unknown function DUF1501  40.45 
 
 		 386 aa  269  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3912  hypothetical protein  42.68 
 
 		 387 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4376  hypothetical protein  42.68 
 
 		 387 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4086  hypothetical protein  40.79 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2539  protein of unknown function DUF1501  43.9 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1625  hypothetical protein  41.34 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177694  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5025  protein of unknown function DUF1501  40 
 
 		 382 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137288  normal  0.0850645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4217  hypothetical protein  41.18 
 
 		 407 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  34.88 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2852  hypothetical protein  37.46 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2473  protein of unknown function DUF1501  36.41 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2181  hypothetical protein  38.83 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4004  hypothetical protein  38.21 
 
 		 403 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2353  hypothetical protein  40.27 
 
 		 389 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2183  protein of unknown function DUF1501  36.2 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0901909  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  33.51 
 
 		 408 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2868  hypothetical protein  34.43 
 
 		 413 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  33.58 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0377  protein of unknown function DUF1501  34.38 
 
 		 422 aa  170  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3059  hypothetical protein  30.9 
 
 		 429 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2281  hypothetical protein  33.25 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118635  hitchhiker  0.0000220293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5538  hypothetical protein  32.8 
 
 		 395 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889473  normal  0.0405308 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4837  hypothetical protein  32.1 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2158  hypothetical protein  31.12 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3484  hypothetical protein  31.83 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4116  protein of unknown function DUF1501  30.83 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0704  protein of unknown function DUF1501  28.35 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6011  hypothetical protein  33.07 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4878  hypothetical protein  29.05 
 
 		 445 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0245766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02839  hypothetical protein  32.28 
 
 		 379 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5180  hypothetical protein  33.53 
 
 		 395 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134419  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3315  protein of unknown function DUF1501  31 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0967  hypothetical protein  29.32 
 
 		 406 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  27.12 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1205  hypothetical protein  27.86 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2722  hypothetical protein  31.45 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1681  hypothetical protein  31.79 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2304  hypothetical protein  28.37 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.947185  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  25.49 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3876  protein of unknown function DUF1501  31.99 
 
 		 425 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1974  hypothetical protein  32.13 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1882  protein of unknown function DUF1501  28.86 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6144  twin-arginine translocation pathway signal  29.97 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1935  hypothetical protein  29.97 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884799  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1959  hypothetical protein  29.97 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.309737  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5246  hypothetical protein  30.03 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  27.8 
 
 		 513 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  29.94 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0518  hypothetical protein  26.13 
 
 		 388 aa  99.8  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1923  hypothetical protein  29.15 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1850  hypothetical protein  27.86 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00703093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  29.94 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1336  hypothetical protein  28.48 
 
 		 403 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000214784 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2348  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.35 
 
 		 413 aa  96.3  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  24.24 
 
 		 404 aa  96.3  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1651  hypothetical protein  29.94 
 
 		 394 aa  96.3  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2503  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.35 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2390  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.35 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1483  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.35 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0185486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2097  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.22 
 
 		 420 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1976  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.35 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.611081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3329  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.35 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0404389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1249  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.35 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66735  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  26.69 
 
 		 524 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1611  hypothetical protein  27.66 
 
 		 445 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00173364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  28.8 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1005  hypothetical protein  29.1 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354968  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2116  protein of unknown function DUF1501  25.51 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1103  protein of unknown function DUF1501  28.43 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0048  protein of unknown function DUF1501  24.16 
 
 		 509 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000158784  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2473  protein of unknown function DUF1501  28.75 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  decreased coverage  0.00457551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1451  hypothetical protein  26.12 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3364  hypothetical protein  22.7 
 
 		 565 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.752802  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0167  protein of unknown function DUF1501  28.57 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2448  hypothetical protein  25.87 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.236933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2238  hypothetical protein  23.94 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2551  protein of unknown function DUF1501  24.55 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201136  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  23.31 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06463  hypothetical protein  35.4 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1789  protein of unknown function DUF1501  33.6 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1187  twin-arginine translocation pathway signal  24.23 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2387  hypothetical protein  35.83 
 
 		 514 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  32.04 
 
 		 442 aa  53.1  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000085  DUF1501 domain-containing protein  23.59 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4495  hypothetical protein  42.35 
 
 		 482 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4095  protein of unknown function DUF1501  38.61 
 
 		 432 aa  50.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4705  hypothetical protein  42.35 
 
 		 481 aa  50.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3720  protein of unknown function DUF1501  36.47 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1728  protein of unknown function DUF1501  33.08 
 
 		 449 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3514  hypothetical protein  26.62 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0916385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3817  protein of unknown function DUF1501  40.26 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0335  protein of unknown function DUF1501  34.95 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0518  protein of unknown function DUF1501  31.93 
 
 		 485 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>