75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4495 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4705  hypothetical protein  88.38 
 
 		 481 aa  839    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4495  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  969    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2387  hypothetical protein  43.41 
 
 		 514 aa  340  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1187  twin-arginine translocation pathway signal  37.02 
 
 		 448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3514  hypothetical protein  38.67 
 
 		 483 aa  256  9e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0916385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000085  DUF1501 domain-containing protein  34.03 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40571  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06463  hypothetical protein  30.83 
 
 		 448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0048  protein of unknown function DUF1501  27.93 
 
 		 509 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000158784  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  27.12 
 
 		 524 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  26.35 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  26.26 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0518  hypothetical protein  24.04 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  26.48 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  28.12 
 
 		 513 aa  90.1  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1451  hypothetical protein  26.25 
 
 		 410 aa  87.4  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1611  hypothetical protein  27.16 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00173364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1959  hypothetical protein  27.48 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.309737  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6144  twin-arginine translocation pathway signal  27.25 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1935  hypothetical protein  27.25 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884799  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1336  hypothetical protein  27.32 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000214784 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  24.69 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  26.9 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0967  hypothetical protein  28.31 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  26.67 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5246  hypothetical protein  26.84 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2348  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.25 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2390  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.25 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2503  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.25 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1651  hypothetical protein  27.11 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2473  protein of unknown function DUF1501  26.2 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  decreased coverage  0.00457551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0377  protein of unknown function DUF1501  26.15 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2097  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.41 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2448  hypothetical protein  26.77 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.236933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1976  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.25 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.611081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1249  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.25 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3329  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.25 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0404389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1483  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.25 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0185486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1882  protein of unknown function DUF1501  29.15 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1923  hypothetical protein  25.89 
 
 		 403 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3364  hypothetical protein  31.14 
 
 		 565 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.752802  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2304  hypothetical protein  25.05 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.947185  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1850  hypothetical protein  25.18 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00703093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1103  protein of unknown function DUF1501  27.47 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2868  hypothetical protein  25.65 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2238  hypothetical protein  24.68 
 
 		 399 aa  67  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2551  protein of unknown function DUF1501  24.74 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1789  protein of unknown function DUF1501  27.3 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  27.03 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3059  hypothetical protein  25.75 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2116  protein of unknown function DUF1501  22.7 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199943  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  29.07 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4878  hypothetical protein  32.32 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0245766  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4837  hypothetical protein  28.92 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0704  protein of unknown function DUF1501  35.16 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  21.51 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5538  hypothetical protein  25.34 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889473  normal  0.0405308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4116  protein of unknown function DUF1501  26.97 
 
 		 401 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  27.59 
 
 		 387 aa  56.6  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2158  hypothetical protein  29.81 
 
 		 439 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2722  hypothetical protein  27.25 
 
 		 412 aa  54.3  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5180  hypothetical protein  25.51 
 
 		 395 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134419  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02839  hypothetical protein  24.28 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  42.35 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3484  hypothetical protein  35.23 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2281  hypothetical protein  26.76 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118635  hitchhiker  0.0000220293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2473  protein of unknown function DUF1501  30.46 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4004  hypothetical protein  31.45 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6011  hypothetical protein  24.8 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2183  protein of unknown function DUF1501  29.8 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0901909  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2181  hypothetical protein  28.97 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3315  protein of unknown function DUF1501  25.77 
 
 		 403 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3443  protein of unknown function DUF1501  29.69 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1205  hypothetical protein  31.3 
 
 		 402 aa  45.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4086  hypothetical protein  29.66 
 
 		 388 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2852  hypothetical protein  25.26 
 
 		 382 aa  44.3  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>