93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0048 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0048  protein of unknown function DUF1501  100 
 
 		 509 aa  1046    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000158784  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  42.25 
 
 		 524 aa  356  6.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  42.18 
 
 		 513 aa  326  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3364  hypothetical protein  39.57 
 
 		 565 aa  310  5e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.752802  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  36.01 
 
 		 415 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  34 
 
 		 404 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0518  hypothetical protein  35.29 
 
 		 388 aa  220  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  33.87 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  34.33 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2473  protein of unknown function DUF1501  35.32 
 
 		 390 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  decreased coverage  0.00457551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2448  hypothetical protein  34.34 
 
 		 390 aa  186  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.236933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  29.93 
 
 		 394 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  30.69 
 
 		 394 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1882  protein of unknown function DUF1501  30.26 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1923  hypothetical protein  30.58 
 
 		 403 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0967  hypothetical protein  30.14 
 
 		 406 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1336  hypothetical protein  29.68 
 
 		 403 aa  172  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000214784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1451  hypothetical protein  28.87 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1850  hypothetical protein  30.08 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00703093 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1959  hypothetical protein  28.7 
 
 		 406 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.309737  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6144  twin-arginine translocation pathway signal  29.8 
 
 		 406 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1935  hypothetical protein  29.8 
 
 		 406 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884799  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5246  hypothetical protein  29.57 
 
 		 406 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2304  hypothetical protein  29.18 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.947185  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1789  protein of unknown function DUF1501  31.92 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2390  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.43 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2503  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.43 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2348  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.43 
 
 		 413 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1483  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.18 
 
 		 414 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0185486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2097  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.43 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1976  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.18 
 
 		 421 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.611081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3329  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.18 
 
 		 421 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0404389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1249  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.18 
 
 		 421 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66735  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1651  hypothetical protein  30.16 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1103  protein of unknown function DUF1501  26.76 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  29.37 
 
 		 410 aa  143  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2868  hypothetical protein  27.91 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  29.22 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1005  hypothetical protein  28.64 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354968  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0377  protein of unknown function DUF1501  27.75 
 
 		 422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4705  hypothetical protein  27.84 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2116  protein of unknown function DUF1501  29.25 
 
 		 405 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1681  hypothetical protein  28.33 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0704  protein of unknown function DUF1501  29.53 
 
 		 422 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3514  hypothetical protein  29.04 
 
 		 483 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0916385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3484  hypothetical protein  29.65 
 
 		 439 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4495  hypothetical protein  27.93 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2238  hypothetical protein  26.03 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2551  protein of unknown function DUF1501  26.26 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201136  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000085  DUF1501 domain-containing protein  26.01 
 
 		 441 aa  110  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2158  hypothetical protein  27.98 
 
 		 439 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3059  hypothetical protein  25.7 
 
 		 429 aa  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1974  hypothetical protein  29.57 
 
 		 414 aa  107  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0167  protein of unknown function DUF1501  26.7 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2722  hypothetical protein  27.66 
 
 		 412 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1611  hypothetical protein  35.06 
 
 		 445 aa  103  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00173364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3876  protein of unknown function DUF1501  29.65 
 
 		 425 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1187  twin-arginine translocation pathway signal  27.55 
 
 		 448 aa  94  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1205  hypothetical protein  25.75 
 
 		 402 aa  90.9  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1385  hypothetical protein  24.28 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18972  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2473  protein of unknown function DUF1501  25.32 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2539  protein of unknown function DUF1501  24.37 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1794  hypothetical protein  23.62 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  24.81 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5828  hypothetical protein  25.28 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00482968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2183  protein of unknown function DUF1501  24.46 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0901909  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3893  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4475  hypothetical protein  25 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4086  hypothetical protein  22.84 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2387  hypothetical protein  26.72 
 
 		 514 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6011  hypothetical protein  24.78 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1625  hypothetical protein  26.17 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177694  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5025  protein of unknown function DUF1501  25.93 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137288  normal  0.0850645 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2340  hypothetical protein  25.3 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40083  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  24.16 
 
 		 407 aa  79.7  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2281  hypothetical protein  25.31 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118635  hitchhiker  0.0000220293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4116  protein of unknown function DUF1501  23.87 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3315  protein of unknown function DUF1501  24.13 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3912  hypothetical protein  23.47 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02839  hypothetical protein  25.61 
 
 		 379 aa  76.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5538  hypothetical protein  23.81 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889473  normal  0.0405308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4376  hypothetical protein  23.36 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06463  hypothetical protein  28.16 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3443  protein of unknown function DUF1501  23.19 
 
 		 386 aa  73.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4004  hypothetical protein  24.7 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2353  hypothetical protein  25.06 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2181  hypothetical protein  25.06 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5180  hypothetical protein  23.57 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134419  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4837  hypothetical protein  24.3 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4217  hypothetical protein  25.64 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4878  hypothetical protein  22.89 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0245766  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2852  hypothetical protein  23.71 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>