More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1130 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1130  proteinase  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  62.77 
 
 		 192 aa  240  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  62.77 
 
 		 192 aa  239  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  60.22 
 
 		 186 aa  238  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  62.77 
 
 		 192 aa  237  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  62.11 
 
 		 190 aa  237  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  61.05 
 
 		 190 aa  236  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  59.56 
 
 		 186 aa  231  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  58.15 
 
 		 187 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  56.45 
 
 		 186 aa  226  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  57.07 
 
 		 187 aa  224  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  57.61 
 
 		 187 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  56.91 
 
 		 192 aa  222  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  53.8 
 
 		 187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  53.26 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  57.92 
 
 		 197 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  55.56 
 
 		 194 aa  206  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  53.98 
 
 		 182 aa  201  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  50 
 
 		 183 aa  195  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  53.71 
 
 		 181 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  54.34 
 
 		 181 aa  187  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  46.74 
 
 		 189 aa  187  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  45.56 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  49.16 
 
 		 188 aa  184  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  46.93 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  49.16 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  51.41 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  44.26 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  48.3 
 
 		 190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  46.93 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  52.91 
 
 		 183 aa  177  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  48.59 
 
 		 190 aa  177  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  46.45 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  46.7 
 
 		 194 aa  171  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  47.46 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  47.62 
 
 		 189 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  44.32 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  47.7 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  47.62 
 
 		 189 aa  167  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  44.62 
 
 		 189 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  48.28 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  45.76 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  44.75 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  44.69 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  51.48 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  51.48 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  51.48 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  47.34 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  46.11 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  47.22 
 
 		 189 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  44.26 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  47.67 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  46.89 
 
 		 188 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  47.31 
 
 		 245 aa  154  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  45.66 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  45.88 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0228  intracellular protease, PfpI family  46.33 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  46.11 
 
 		 168 aa  151  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  45.88 
 
 		 183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  47.09 
 
 		 188 aa  150  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  43.11 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  49.11 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  48.81 
 
 		 182 aa  148  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  43.68 
 
 		 182 aa  148  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  43.68 
 
 		 182 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  43.43 
 
 		 189 aa  147  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09940  putative protease  45.98 
 
 		 187 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  43.68 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  43.68 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  39.78 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0922  putative protease  45.25 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  43.86 
 
 		 241 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1647  PfpI family intracellular peptidase  48.48 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.920714 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  43.11 
 
 		 187 aa  145  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  39.23 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  43.1 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  40.91 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  42.05 
 
 		 181 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  42.44 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  40.46 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  45.06 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  45.06 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  45.06 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  45.06 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  41.01 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  45.06 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  45.06 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  45.06 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31560  intracellular protease, PfpI family  45.86 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.568268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  42.11 
 
 		 192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  38.95 
 
 		 180 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  44.44 
 
 		 172 aa  138  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  40 
 
 		 183 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  39.53 
 
 		 180 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5584  PfpI family intracellular peptidase  42.11 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  44.44 
 
 		 172 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  41.71 
 
 		 179 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  40.23 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  39.11 
 
 		 199 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  41.04 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>