285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0506 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6911  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  76.32 
 
 		 495 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5918  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  75.1 
 
 		 497 aa  732    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0506  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 495 aa  978    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6593  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  60.89 
 
 		 497 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.783722  normal  0.178286 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5619  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  59.96 
 
 		 497 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75216  normal  0.2633 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5747  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  60.68 
 
 		 497 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6111  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  60.68 
 
 		 497 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5836  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  59.62 
 
 		 497 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1825  histidine ammonia-lyase  56.58 
 
 		 549 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4838  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  56.79 
 
 		 549 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5104  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  56.38 
 
 		 534 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.0115263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2586  histidine ammonia-lyase  58.93 
 
 		 504 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206795  normal  0.158772 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2648  histidine ammonia-lyase  51.12 
 
 		 500 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1260  histidine ammonia-lyase  50.92 
 
 		 523 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  47.96 
 
 		 513 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  48.55 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  48.16 
 
 		 507 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  49.29 
 
 		 510 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  48.88 
 
 		 510 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0799  histidine ammonia-lyase  46.86 
 
 		 507 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.873754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  39.06 
 
 		 507 aa  335  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  37.87 
 
 		 516 aa  323  6e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  39.54 
 
 		 507 aa  307  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  38.53 
 
 		 508 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  40.41 
 
 		 509 aa  306  8.000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  40.85 
 
 		 506 aa  296  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  38.92 
 
 		 511 aa  288  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  41.44 
 
 		 499 aa  286  7e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  39.46 
 
 		 506 aa  280  6e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  35.86 
 
 		 505 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  35.86 
 
 		 505 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  35.86 
 
 		 505 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  35.86 
 
 		 505 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  35.65 
 
 		 505 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  35.86 
 
 		 505 aa  276  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  35.44 
 
 		 505 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  35.44 
 
 		 505 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  35.65 
 
 		 505 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  35.65 
 
 		 505 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  35.65 
 
 		 506 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  35.49 
 
 		 498 aa  273  6e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  36.51 
 
 		 508 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  36.86 
 
 		 519 aa  268  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  38.18 
 
 		 513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  37.21 
 
 		 511 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4557  histidine ammonia-lyase  37.24 
 
 		 524 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.449486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 		 509 aa  266  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  37.47 
 
 		 507 aa  266  8.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  42.11 
 
 		 508 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  37.5 
 
 		 511 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  34.53 
 
 		 504 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  40.09 
 
 		 515 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  34.53 
 
 		 504 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0908  histidine ammonia-lyase  40.09 
 
 		 497 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  35.96 
 
 		 509 aa  264  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  38.21 
 
 		 515 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  41.86 
 
 		 508 aa  262  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  36.44 
 
 		 514 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  36.34 
 
 		 538 aa  261  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  36.58 
 
 		 511 aa  261  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  41.26 
 
 		 508 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  39.72 
 
 		 518 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  36.23 
 
 		 511 aa  259  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  36.73 
 
 		 515 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  38.04 
 
 		 526 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  37.6 
 
 		 536 aa  256  5e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  38.09 
 
 		 514 aa  256  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  36.52 
 
 		 515 aa  256  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  38.52 
 
 		 508 aa  254  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  36.94 
 
 		 506 aa  253  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  36.65 
 
 		 510 aa  253  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4069  histidine ammonia-lyase  38.13 
 
 		 511 aa  253  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.790613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 523 aa  252  9.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  36.81 
 
 		 511 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5047  histidine ammonia-lyase  37.13 
 
 		 518 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  37.15 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5637  histidine ammonia-lyase  37.97 
 
 		 518 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  39.47 
 
 		 515 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  36.94 
 
 		 510 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1932  histidine ammonia-lyase  36.71 
 
 		 520 aa  250  4e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  38.92 
 
 		 516 aa  250  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  36.73 
 
 		 510 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  38.95 
 
 		 517 aa  249  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  39.43 
 
 		 518 aa  249  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  35.23 
 
 		 503 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  37.58 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  36.89 
 
 		 511 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  35.94 
 
 		 510 aa  248  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  35.6 
 
 		 510 aa  247  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  35.25 
 
 		 513 aa  247  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  35.67 
 
 		 510 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  36.52 
 
 		 510 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5831  histidine ammonia-lyase  37.58 
 
 		 524 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  36.93 
 
 		 504 aa  246  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  36.55 
 
 		 505 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67320  histidine ammonia-lyase  37.37 
 
 		 509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  37.24 
 
 		 520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  36.1 
 
 		 512 aa  244  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  38.89 
 
 		 517 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  36.4 
 
 		 524 aa  243  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>