More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4347 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  78.81 
 
 		 236 aa  386  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  72 
 
 		 226 aa  324  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.37 
 
 		 225 aa  318  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.37 
 
 		 225 aa  318  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  63.39 
 
 		 229 aa  288  7e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2027  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.67 
 
 		 240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2305  two component transcriptional regulator  66.96 
 
 		 228 aa  270  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5187  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000511147 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5305  winged helix family two component transcriptional regulator  46.06 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217359  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.09 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0691  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  45.5 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  45.5 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.53 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.53 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  45.5 
 
 		 224 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  44.59 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  44.59 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  44.59 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  46.19 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  43.69 
 
 		 223 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  46.4 
 
 		 226 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  43.69 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4389  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  51.17 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 283 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.4 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  47.77 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.4 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5331  transcriptional regulator two components regulatory system  44.16 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 223 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 224 aa  185  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.95 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00315  probable two component response regulator transcription regulator protein  45.09 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0708  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.75 
 
 		 226 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328024  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.27 
 
 		 238 aa  184  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  45.05 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.4 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.49 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1376  DNA-binding response regulator IrlR  47.3 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.85 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.85 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.85 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 235 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.24 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 246 aa  181  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1028  DNA-binding response regulator IrlR  47.3 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0282692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.05 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1596  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.05 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0030  DNA-binding response regulator IrlR  47.3 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.4 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  42.34 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0402  transcriptional activator IrlR  47.3 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0800763  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 238 aa  180  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1439  transcriptional activator IrlR  47.3 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1180  transcriptional activator IrlR  47.3 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0831411  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  47.3 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  47.3 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.5 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.5 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.5 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6173  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.4 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>