46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4143 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4143  amidohydrolase 2  100 
 
 
509 aa  1050    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0344533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1913  amidohydrolase 2  69.43 
 
 
505 aa  739    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  29.47 
 
 
367 aa  64.3  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  21.57 
 
 
396 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.97 
 
 
345 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  23.98 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  29.03 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  24.22 
 
 
392 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  31.07 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  21.05 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  27.95 
 
 
335 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  20 
 
 
409 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  20.53 
 
 
409 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  27.5 
 
 
410 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  20.53 
 
 
409 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  20.53 
 
 
409 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  26.85 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  24.38 
 
 
365 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  19.82 
 
 
409 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  22.19 
 
 
392 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  23.88 
 
 
358 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  23.15 
 
 
394 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  25.43 
 
 
312 aa  50.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  27.65 
 
 
398 aa  50.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  25.74 
 
 
429 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
368 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  26.49 
 
 
354 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.89 
 
 
339 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  25.18 
 
 
414 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  22.13 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
325 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  27.11 
 
 
336 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  24.4 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  21.66 
 
 
386 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  23.77 
 
 
378 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  23.47 
 
 
398 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  22.4 
 
 
441 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  24.71 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  24.17 
 
 
343 aa  44.3  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.88 
 
 
350 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  22.95 
 
 
401 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  22.95 
 
 
401 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  22.95 
 
 
401 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  29.17 
 
 
364 aa  43.5  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  22.62 
 
 
409 aa  43.5  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  27.12 
 
 
361 aa  43.5  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>