More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0615 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  87.95 
 
 		 224 aa  407  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.89 
 
 		 224 aa  363  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  77.58 
 
 		 224 aa  357  6e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  67.7 
 
 		 226 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  57.71 
 
 		 236 aa  262  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  59.28 
 
 		 224 aa  261  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.73 
 
 		 225 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  58.64 
 
 		 225 aa  259  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  58.74 
 
 		 224 aa  258  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.09 
 
 		 227 aa  254  5e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.55 
 
 		 227 aa  254  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.46 
 
 		 228 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  55.65 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  55.9 
 
 		 230 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  55.9 
 
 		 230 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  55.9 
 
 		 230 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  55.02 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  55.61 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  55.22 
 
 		 231 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.87 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  52.65 
 
 		 228 aa  238  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.19 
 
 		 229 aa  238  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  53.36 
 
 		 224 aa  236  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.12 
 
 		 224 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  53.36 
 
 		 224 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  56 
 
 		 226 aa  235  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  53.1 
 
 		 227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  53.1 
 
 		 227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2500  winged helix family two component transcriptional regulator  52.61 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.840776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  53.1 
 
 		 227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1922  two component transcriptional regulator  53.36 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  52.65 
 
 		 227 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.39 
 
 		 227 aa  232  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2305  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 228 aa  228  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79647 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  52.44 
 
 		 240 aa  228  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 225 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  50.67 
 
 		 226 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  50 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.56 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3164  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  48.32 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06261  two-component response regulator  49.56 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0419163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  52.73 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.36 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.36 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.13 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  51.6 
 
 		 246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 406 aa  217  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.44 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.67 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.36 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  52.53 
 
 		 227 aa  215  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.88 
 
 		 238 aa  215  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  54.42 
 
 		 228 aa  215  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  47.3 
 
 		 224 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  47.95 
 
 		 224 aa  214  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.64 
 
 		 242 aa  214  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  53.3 
 
 		 229 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.67 
 
 		 271 aa  213  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  51.09 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.75 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  48.21 
 
 		 252 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 219 aa  211  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  48.87 
 
 		 219 aa  211  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 272 aa  211  7.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 273 aa  211  9e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 229 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  47.03 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.32 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  48.91 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.91 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.3 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 224 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  48.18 
 
 		 223 aa  208  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  46.58 
 
 		 224 aa  207  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  46.58 
 
 		 224 aa  207  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  47.79 
 
 		 241 aa  207  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>