177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1407 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1407  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 340 aa  666    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1512  sugar-binding domain-containing protein  47.73 
 
 		 344 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1302  transcription regulator  47.43 
 
 		 344 aa  305  9.000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.368614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1305  DeoR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 340 aa  292  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.371183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15840  transcriptional regulator, DeoR family  43.24 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2019  transcriptional regulator, DeoR family  43.15 
 
 		 342 aa  286  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2963  transcriptional regulator, DeoR family  41.54 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3138  transcriptional regulator, DeoR family  40.36 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3683  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.754905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5243  gapA transcriptional regulator CggR  37.65 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4990  gapA transcriptional regulator CggR  37.65 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4819  central glycolytic genes regulator  37.65 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4829  central glycolytic genes regulator  37.65 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.597699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5370  gapA transcriptional regulator CggR  37.65 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5225  gapA transcriptional regulator CggR  37.65 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5289  gapA transcriptional regulator CggR  37.65 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2274  transcriptional regulator, DeoR family  39.05 
 
 		 357 aa  251  9.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.543883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0441  gap transcriptional regulator  37.98 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0271  transcriptional regulator  38.58 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5254  gapA transcriptional regulator CggR  37.35 
 
 		 342 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0633366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5698  gapA transcriptional regulator CggR  37.35 
 
 		 342 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4932  DeoR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 342 aa  243  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0796  DeoR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0233837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0812  sugar-binding domain-containing protein  37.87 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1309  central glycolytic genes regulator  35.59 
 
 		 343 aa  199  7e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000180259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  26.8 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  27.59 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  24.52 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  25.42 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  25.34 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  25.56 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  25.34 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  25.88 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  24.18 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  24.9 
 
 		 317 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  27.19 
 
 		 314 aa  67  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  27.19 
 
 		 314 aa  67  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  24.9 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  24.9 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  24.9 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  26.25 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  24.56 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  26.23 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  26.23 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  26.23 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  24.35 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  26.23 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  24.35 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2553  DeoR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2598  DeoR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0969479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2592  DeoR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0641807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  25.82 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  24.71 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  23.44 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  21.21 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  26.17 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  26.17 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  26.17 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  26.17 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  26.17 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  26.17 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  25.47 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3240  transcriptional regulator, DeoR family  25.64 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  25.47 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.47 
 
 		 316 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.47 
 
 		 315 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.47 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  25.47 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  23 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.47 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.47 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  25 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  25 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  25 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.55 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  23 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  23 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0496  DeoR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.858474  hitchhiker  0.000586642 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  26.5 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  26 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  20.52 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  22.54 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  27.64 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  22.07 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>