More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4421 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 
494 aa  996    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  69.61 
 
 
492 aa  576  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  51.09 
 
 
515 aa  415  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  39.74 
 
 
464 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  39.74 
 
 
493 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  37.25 
 
 
493 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  37.95 
 
 
476 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  35.56 
 
 
492 aa  267  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  34.36 
 
 
515 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39.24 
 
 
586 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  33.15 
 
 
532 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39.24 
 
 
536 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39.24 
 
 
536 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  39.24 
 
 
536 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  39.24 
 
 
536 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39.24 
 
 
536 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  38.03 
 
 
533 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  32.66 
 
 
487 aa  246  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39.24 
 
 
591 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  38.26 
 
 
535 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  38.26 
 
 
535 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  38.3 
 
 
535 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  33.33 
 
 
514 aa  243  6e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  38.03 
 
 
535 aa  242  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  38.46 
 
 
531 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  37.65 
 
 
532 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  33.47 
 
 
483 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  33.26 
 
 
513 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  33.71 
 
 
513 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.35 
 
 
579 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  31.86 
 
 
556 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  32.83 
 
 
522 aa  219  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  31.37 
 
 
569 aa  207  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  31.84 
 
 
539 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  29.62 
 
 
578 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  30.12 
 
 
636 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  30.12 
 
 
636 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  32.79 
 
 
490 aa  171  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  28.41 
 
 
582 aa  170  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  33.19 
 
 
496 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  29.53 
 
 
516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  32.74 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  27.85 
 
 
536 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  28.35 
 
 
631 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  27.84 
 
 
532 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  30.87 
 
 
506 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  28.34 
 
 
516 aa  156  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  28.72 
 
 
569 aa  155  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  28.13 
 
 
516 aa  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  28.13 
 
 
516 aa  153  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  28.13 
 
 
516 aa  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  28.13 
 
 
516 aa  153  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  25.87 
 
 
688 aa  153  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  28.91 
 
 
538 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  28.15 
 
 
649 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  27.57 
 
 
516 aa  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  27.93 
 
 
529 aa  150  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  27.49 
 
 
460 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  28.96 
 
 
512 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  30.74 
 
 
547 aa  150  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  27.52 
 
 
529 aa  149  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  27.52 
 
 
529 aa  149  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  28.57 
 
 
456 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  28.85 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  27.89 
 
 
596 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  28.52 
 
 
499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  27.33 
 
 
460 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  31.42 
 
 
382 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  28.89 
 
 
527 aa  147  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  28.77 
 
 
551 aa  146  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  30.79 
 
 
521 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  28.29 
 
 
519 aa  145  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  28.19 
 
 
468 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  29.01 
 
 
457 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  27.68 
 
 
504 aa  143  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  28.68 
 
 
457 aa  143  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  28.46 
 
 
459 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  27.18 
 
 
527 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  27.43 
 
 
534 aa  139  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  27.41 
 
 
533 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  27.43 
 
 
534 aa  139  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  27.41 
 
 
533 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  27.83 
 
 
502 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  27.83 
 
 
502 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  27.41 
 
 
533 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  30.61 
 
 
489 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  27.2 
 
 
646 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  25.99 
 
 
487 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  27.08 
 
 
716 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  27.81 
 
 
524 aa  136  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  27.75 
 
 
460 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  28.4 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  24.08 
 
 
725 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  29.06 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  29.23 
 
 
508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  30.85 
 
 
528 aa  133  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  29.32 
 
 
518 aa  133  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  25.83 
 
 
717 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  28.13 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  29.32 
 
 
518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.672954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>