294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2049 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2049  UspA domain-containing protein  100 
 
 
289 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  50.52 
 
 
288 aa  242  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2069  UspA domain protein  47.55 
 
 
288 aa  232  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000374133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  35.92 
 
 
373 aa  122  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  34.9 
 
 
295 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  34.01 
 
 
347 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
294 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  37.68 
 
 
393 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  35.05 
 
 
294 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  32.08 
 
 
287 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 
294 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
293 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
293 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
295 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.46 
 
 
284 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
277 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  32.52 
 
 
285 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
293 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
293 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 
290 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  34.11 
 
 
295 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  34.11 
 
 
295 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  34.11 
 
 
295 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  32.07 
 
 
293 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.18 
 
 
288 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.31 
 
 
299 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  33.68 
 
 
283 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 
277 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  30.27 
 
 
301 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  30.88 
 
 
288 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  30.45 
 
 
288 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  34.83 
 
 
294 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  30.9 
 
 
296 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  34.48 
 
 
294 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
294 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  35.12 
 
 
302 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  34.09 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  40.31 
 
 
276 aa  99.4  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  34.59 
 
 
294 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 
293 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 
295 aa  99  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  33.57 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.1 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  31.4 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  31.4 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
297 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  29.69 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  34.01 
 
 
292 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  31.14 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
292 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  33.22 
 
 
303 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  32.69 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  30.33 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  29.55 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  30.48 
 
 
296 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  30.71 
 
 
281 aa  92.8  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  31.01 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  31.03 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
341 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  30.07 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  32.31 
 
 
294 aa  89.4  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  30.29 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  30.85 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  30.43 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  31.31 
 
 
323 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  30.74 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  32.65 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  30.8 
 
 
275 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  30.17 
 
 
339 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  35.21 
 
 
274 aa  85.9  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 
289 aa  85.5  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  29.37 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  35.57 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  31.03 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  30.1 
 
 
289 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  28.42 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  31.67 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  32.08 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  40 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  27.87 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  29.22 
 
 
308 aa  82  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  31.51 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  36.49 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1833  UspA domain protein  32.98 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0847869  normal  0.369126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  30.69 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  30.23 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1997  UspA domain-containing protein  30.54 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  40.74 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  33.48 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  30.41 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  27.18 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  28.37 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>