More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0263 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
338 aa  684    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  79.88 
 
 
350 aa  537  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.69 
 
 
327 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.55 
 
 
333 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  59.82 
 
 
329 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.37 
 
 
342 aa  334  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.46 
 
 
335 aa  326  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.61 
 
 
339 aa  315  5e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.24 
 
 
339 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  47.53 
 
 
327 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.9 
 
 
326 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.89 
 
 
336 aa  183  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.4 
 
 
336 aa  174  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 
331 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  31.97 
 
 
313 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
311 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
310 aa  95.9  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.83 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
310 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
309 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
309 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  28.63 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  28.02 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  31.65 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  22.22 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  28.83 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  25 
 
 
323 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  25.95 
 
 
332 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  21.16 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.96 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.05 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  21.16 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  24.62 
 
 
746 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0618  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.08 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  26.02 
 
 
341 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  31.69 
 
 
304 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
328 aa  63.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 
321 aa  63.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
352 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  26.97 
 
 
341 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  20.33 
 
 
306 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43169  predicted protein  26.89 
 
 
404 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0856686  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  25.74 
 
 
361 aa  59.7  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  27.04 
 
 
331 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.77 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.7 
 
 
335 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  25.77 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  25.09 
 
 
341 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  24.7 
 
 
338 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.77 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  25.09 
 
 
340 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.17 
 
 
333 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  24.7 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.77 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  24.7 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  24.7 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.39 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 
372 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121065  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  25.9 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  25.9 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2173  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0967474  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  26.56 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  25.77 
 
 
321 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 
299 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.49 
 
 
345 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  25.55 
 
 
345 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
314 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  24.73 
 
 
340 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 
328 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  25.3 
 
 
335 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  24.73 
 
 
340 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.04 
 
 
294 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  25.09 
 
 
340 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
328 aa  57  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
349 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  26.14 
 
 
331 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
335 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
335 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
335 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  25.3 
 
 
335 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.85 
 
 
321 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3798  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
344 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387174  normal  0.267254 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.14 
 
 
338 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  26.64 
 
 
336 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
368 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>