88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1085 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1085  Rhomboid family protein  100 
 
 		 204 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1033  rhomboid-like protein  80.85 
 
 		 198 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1093  Rhomboid family protein  79.79 
 
 		 198 aa  260  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0800  rhomboid family protein  40.38 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1467  hypothetical protein  32.34 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2350  rhomboid family protein  28.25 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0538538  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  28.83 
 
 		 279 aa  51.6  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2522  rhomboid family membrane protein  27.88 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2047  rhomboid family protein  29.41 
 
 		 171 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285623  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0230  membrane protein, rhomboid family  31.41 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  35.19 
 
 		 276 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  35.19 
 
 		 276 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  35.19 
 
 		 276 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  35.19 
 
 		 276 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  35.19 
 
 		 276 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  35.19 
 
 		 276 aa  49.7  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  35.19 
 
 		 276 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  35.19 
 
 		 276 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  35.19 
 
 		 276 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1088  integral membrane protein  31.67 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01423  hypothetical protein  29.33 
 
 		 162 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  29.41 
 
 		 277 aa  48.5  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  37.08 
 
 		 303 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  39.24 
 
 		 289 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4990  peptidase S54-type, rhomboid-like protein  37.08 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25145  normal  0.208438 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0169  Rhomboid family protein  30.11 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  31.97 
 
 		 292 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  24.28 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  30.71 
 
 		 292 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2486  hypothetical protein  36.89 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  24.28 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2165  rhomboid family protein  31.31 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1915  rhomboid family protein  31.31 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2060  rhomboid family protein  32.32 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  39.74 
 
 		 298 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  25.85 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  28.95 
 
 		 289 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  28.95 
 
 		 289 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2553  rhomboid family protein  25.57 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0621154  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  39.33 
 
 		 290 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  28.95 
 
 		 289 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  34.04 
 
 		 274 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  34.04 
 
 		 274 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  34.04 
 
 		 276 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  34.04 
 
 		 276 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  34.04 
 
 		 276 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1567  hypothetical protein  29.1 
 
 		 183 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.018833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2063  rhomboid family protein  28.76 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  29.29 
 
 		 280 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004038  membrane protein  27.1 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.03896  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  33.87 
 
 		 371 aa  45.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2114  rhomboid family protein  29.91 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343017  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4542  hypothetical protein  29.91 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2270  Rhomboid family protein  29.91 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00653341  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 340 aa  45.1  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  30.85 
 
 		 277 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  31.63 
 
 		 277 aa  44.7  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  24.51 
 
 		 190 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  24.51 
 
 		 190 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  31.4 
 
 		 287 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2892  putative transmembrane protein  32.26 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  23.12 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  28.66 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  29.49 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  28.21 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  27.32 
 
 		 271 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  37.78 
 
 		 279 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  32.98 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  39.06 
 
 		 579 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2655  hypothetical protein  37.78 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0888  rhomboid family protein  26.36 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.86404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1827  hypothetical protein  34.48 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  41.82 
 
 		 356 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2256  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.18089  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2504  hypothetical protein  31.07 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  31.58 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  31.19 
 
 		 356 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  35.96 
 
 		 292 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2148  rhomboid family membrane protein  27.5 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2052  hypothetical protein  28.07 
 
 		 286 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00391881  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  30.48 
 
 		 293 aa  42  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34050  Rhomboid family membrane protease  34.06 
 
 		 281 aa  42  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  27.03 
 
 		 280 aa  41.6  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  25.64 
 
 		 182 aa  41.6  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 306 aa  41.6  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1853  rhomboid family protein  25.64 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  31.9 
 
 		 284 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02194  membrane protein, Rhomboid family  25.45 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>