38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2109 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2109  cytochrome c, class III  100 
 
 
92 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362801  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2159  cytochrome c3  72.63 
 
 
95 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.083665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2249  cytochrome c3  72.63 
 
 
95 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0270252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2158  cytochrome c class III  75.82 
 
 
92 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1697  cytochrome c, class III  71.43 
 
 
92 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.464908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1696  cytochrome c3  70.53 
 
 
95 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.967705  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2248  cytochrome c class III  74.73 
 
 
92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2108  cytochrome c class III  77.27 
 
 
93 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  0.0343945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  56.04 
 
 
92 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4043  cytochrome c3  54.26 
 
 
94 aa  87  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4134  cytochrome c3  53.19 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4121  hypothetical protein  51.61 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000214496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4049  hypothetical protein  50.54 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4139  hypothetical protein  47.31 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3166  cytochrome c3  51.61 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000727322  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2902  cytochrome c3  47.31 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.89288e-20  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3843  hypothetical protein  51.61 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000284189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0364  cytochrome c3  56.52 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0118878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4124  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000103022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  46.81 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1846  cytochrome c3  37.63 
 
 
90 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000645892  normal  0.876461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  41.49 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1760  cytochrome c3  40.45 
 
 
90 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.50248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  46.81 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0335  cytochrome c3  42.35 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164086  hitchhiker  4.79814e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  43.62 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1891  hypothetical protein  40 
 
 
335 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  38.78 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0365  cytochrome c3  33.7 
 
 
95 aa  50.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2073  hypothetical protein  36.36 
 
 
338 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1988  hypothetical protein  36.36 
 
 
338 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2758  cytochrome c3  40.22 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000293366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3165  cytochrome c3  34.44 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000310643  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1628  cytochrome c7  31.75 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.70701e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1303  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161444  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  28.21 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  30.89 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2013  cytochrome c class III  36.84 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000196406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>