More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0303 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0303  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 
202 aa  406  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0138909  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0225  ribosomal protein L4/L1e  44.13 
 
 
210 aa  140  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1866  50S ribosomal protein L4  40.51 
 
 
213 aa  137  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0257015  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  38.95 
 
 
210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  40.8 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  40.23 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  35.03 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  38.67 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  36.41 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0060  50S ribosomal protein L4  41.28 
 
 
200 aa  131  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03170  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 
201 aa  130  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000977912  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0394  ribosomal protein L4/L1e  40.34 
 
 
201 aa  130  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000162947  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4642  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 
201 aa  130  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120541  normal  0.0370586 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03121  hypothetical protein  40.34 
 
 
201 aa  130  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000877437  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3704  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 
201 aa  130  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0394  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 
201 aa  130  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000249214  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3743  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 
201 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.0176443 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3802  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 
201 aa  130  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166287  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3806  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 
201 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000172532  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3635  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 
201 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00226471  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3614  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 
201 aa  130  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000161283  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3513  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 
201 aa  130  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109628  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3635  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 
201 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871014  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3708  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 
201 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  0.838559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  38.38 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  39.78 
 
 
223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3750  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000124791  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  39.52 
 
 
222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  35.36 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  37.69 
 
 
216 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6048  50S ribosomal protein L4  39.66 
 
 
247 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3821  50S ribosomal protein L4  39.77 
 
 
201 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000757079  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  38.8 
 
 
209 aa  129  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  38.2 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4000  50S ribosomal protein L4  39.77 
 
 
201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000185721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4543  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 
201 aa  128  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000261898  hitchhiker  0.00202926 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0427  50S ribosomal protein L4  42.59 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154423  decreased coverage  0.00000614317 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3523  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 
201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000000876425  hitchhiker  0.00000726358 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  34.44 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  37.19 
 
 
216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0485  50S ribosomal protein L4  43.21 
 
 
200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000238586  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0490  50S ribosomal protein L4  43.21 
 
 
200 aa  128  6e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109229  normal  0.0102301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0284  50S ribosomal protein L4  39.34 
 
 
201 aa  128  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000222015  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3914  50S ribosomal protein L4  39.34 
 
 
201 aa  128  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.05295e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  37.78 
 
 
204 aa  128  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0585  50S ribosomal protein L4  39.34 
 
 
201 aa  128  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000207865  normal  0.110437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1124  ribosomal protein L4/L1e  41.18 
 
 
248 aa  128  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  39.78 
 
 
210 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  35.91 
 
 
208 aa  127  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  36.61 
 
 
204 aa  127  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  38.25 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0583  50S ribosomal protein L4  38.51 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  40.34 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5786  ribosomal protein L4/L1e  35.87 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  39.64 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  36.56 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0406  50S ribosomal protein L4  39.77 
 
 
201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00340494  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2618  50S ribosomal protein L4/L1e  38.58 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0455519  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  41.07 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0324  50S ribosomal protein L4  39.77 
 
 
201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000187067  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  38.8 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  38.2 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  36.11 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  40.12 
 
 
223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  35.96 
 
 
207 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3161  50S ribosomal protein L4  36.78 
 
 
208 aa  126  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  36.11 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  37.16 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  36.36 
 
 
210 aa  125  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  38.15 
 
 
211 aa  124  8.000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2168  ribosomal protein L4/L1e  40.12 
 
 
201 aa  124  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00358872  normal  0.2798 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00446  50S ribosomal protein L4  42.53 
 
 
201 aa  124  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000113118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  35.59 
 
 
207 aa  124  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  36.07 
 
 
208 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  38.17 
 
 
210 aa  124  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  41.07 
 
 
292 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  40 
 
 
219 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4320  ribosomal protein L4/L1e  37.93 
 
 
204 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  40 
 
 
219 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0932  ribosomal protein L4/L1e  39.77 
 
 
217 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  40 
 
 
219 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0159  50S ribosomal protein L4  39.33 
 
 
201 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  decreased coverage  0.0000448668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0200  50S ribosomal protein L4  40.45 
 
 
201 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000425276  unclonable  0.0000000000211023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0195  50S ribosomal protein L4  40.45 
 
 
201 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00202265  decreased coverage  0.000317476 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  35.36 
 
 
207 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  36.67 
 
 
206 aa  122  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0307  50S ribosomal protein L4P  37.08 
 
 
220 aa  122  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  38.24 
 
 
234 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001741  LSU ribosomal protein L4p (L1e)  41.18 
 
 
200 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000116803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0422  50S ribosomal protein L4  38.34 
 
 
202 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00655238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  37.36 
 
 
206 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4169  50S ribosomal protein L4  39.89 
 
 
201 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170676  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3758  50S ribosomal protein L4  39.89 
 
 
201 aa  121  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000815073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0232  50S ribosomal protein L4  39.89 
 
 
201 aa  121  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0197  50S ribosomal protein L4  39.89 
 
 
201 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174855  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0171  50S ribosomal protein L4  39.89 
 
 
201 aa  121  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000251  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0201  50S ribosomal protein L4  39.89 
 
 
201 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000483773  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4055  50S ribosomal protein L4  39.89 
 
 
201 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000789198  unclonable  0.00000000000665609 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0200  50S ribosomal protein L4  39.89 
 
 
201 aa  121  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000634413  hitchhiker  0.00000000166621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0214  50S ribosomal protein L4  38.8 
 
 
201 aa  121  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000322212  unclonable  0.00000755245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>