More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4812 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4812  cytochrome P450-family protein  100 
 
 
446 aa  896    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2803  putative cytochrome P450-family protein  50.25 
 
 
414 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348302  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5490  putative cytochrome P450  50.69 
 
 
437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0347822  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1142  putative cytochrome P450  51.78 
 
 
421 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15529  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2751  putative cytochrome P450-family protein  47.46 
 
 
426 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.581871  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5491  putative cytochrome P450  46.87 
 
 
488 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767325  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4334  putative cytochrome P450  40.63 
 
 
484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33530  cytochrome P450  38.12 
 
 
410 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.101916  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2975  putative cytochrome P450  35.38 
 
 
452 aa  224  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4583  putative cytochrome P450  35.98 
 
 
471 aa  216  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2597  Cytochrome P450  35.36 
 
 
500 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  0.048774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1747  putative cytochrome P450  32.73 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0264528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3959  Cytochrome P450-like protein  34.26 
 
 
465 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4556  putative cytochrome P450  31.34 
 
 
442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1433  Cytochrome P450-like protein  30.75 
 
 
424 aa  173  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.667112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4420  putative cytochrome P450  34.29 
 
 
440 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4184  cytochrome P450 monooxygenase  31.73 
 
 
406 aa  156  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1685  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  28.89 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  28.72 
 
 
412 aa  126  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  27.58 
 
 
409 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  28.78 
 
 
417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  25 
 
 
411 aa  120  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  30.51 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  25.49 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  25.49 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  25.85 
 
 
411 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  27.32 
 
 
424 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  25.25 
 
 
411 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  25.25 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  25.31 
 
 
411 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  24.26 
 
 
411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  25.49 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  25.49 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  24.63 
 
 
411 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  28.83 
 
 
396 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  26.11 
 
 
405 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  26.79 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  27.03 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  30.48 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  26.48 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  29.08 
 
 
409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  30.15 
 
 
406 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  28.22 
 
 
412 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  28.45 
 
 
366 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  27.81 
 
 
391 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  23.66 
 
 
411 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  29.72 
 
 
401 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  26.91 
 
 
400 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  28.78 
 
 
400 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  29.88 
 
 
408 aa  103  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  28.53 
 
 
417 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  27.01 
 
 
436 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  28.77 
 
 
402 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  28.42 
 
 
398 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  30.18 
 
 
408 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  27.37 
 
 
422 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  27.6 
 
 
420 aa  100  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  29.5 
 
 
411 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  27.84 
 
 
419 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  29.5 
 
 
439 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  30.1 
 
 
403 aa  99  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  26.6 
 
 
408 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  28.28 
 
 
406 aa  99  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  26.98 
 
 
408 aa  97.8  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  27.68 
 
 
423 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  28.68 
 
 
415 aa  97.1  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  27.23 
 
 
402 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  28.88 
 
 
410 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  27.65 
 
 
398 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  28.13 
 
 
399 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  23.1 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  25.54 
 
 
405 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  26 
 
 
421 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  27.76 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  28.02 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  29.9 
 
 
399 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  27.16 
 
 
436 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  29.55 
 
 
395 aa  94  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  27.37 
 
 
398 aa  94  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  25.59 
 
 
399 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  26.8 
 
 
400 aa  93.2  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  26.72 
 
 
401 aa  93.2  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  26.3 
 
 
367 aa  93.2  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  27.5 
 
 
410 aa  93.2  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  27.79 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  27.04 
 
 
402 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  28.15 
 
 
409 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  27.54 
 
 
406 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  26.53 
 
 
407 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  26.53 
 
 
407 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  29.25 
 
 
394 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  30.12 
 
 
410 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  27.57 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  28.03 
 
 
424 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  25.56 
 
 
401 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  28.42 
 
 
405 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  28.42 
 
 
405 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  25.13 
 
 
387 aa  89.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  26.37 
 
 
418 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  28.83 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>