69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3693 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  100 
 
 		 65 aa  127  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  49.21 
 
 		 73 aa  62  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  47.54 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  50 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  46.03 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  50 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  47.54 
 
 		 68 aa  57  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  41.27 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  46.67 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  45 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  41.67 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  48.44 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  51.79 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  50 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  51.79 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  42.62 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  46.55 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  50.94 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.46 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  38.71 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  49.12 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  38.71 
 
 		 349 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  49.09 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  48.21 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  40.98 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  41.67 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  39.68 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  44.26 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  49.18 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  40.32 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  49.15 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  50 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  43.4 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  45.1 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  41.82 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  41.82 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  36.92 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  38.89 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  42.19 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  40 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  30.65 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  41.82 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  30.65 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  44 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  43.86 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  33.9 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  41.27 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2729  protein of unknown function DUF1271  43.86 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4883  hypothetical protein  34.72 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190233  normal  0.299907 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  41.27 
 
 		 79 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  43.4 
 
 		 68 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 62 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  34.48 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  33.9 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  42.19 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  42.19 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  42.19 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.65 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  35.94 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  37.29 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.87 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.2 
 
 		 62 aa  40.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  32.26 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  32.26 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  32.26 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  36.67 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  36.21 
 
 		 62 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>