More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3399 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 117 aa  221  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  64.35 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  60.53 
 
 		 123 aa  130  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  64.29 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  60 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  62.39 
 
 		 119 aa  103  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 129 aa  96.7  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  49.14 
 
 		 120 aa  97.1  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  50.42 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  45.22 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  47.41 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  56.58 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  46.94 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  46.9 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1819  transcriptional regulator, GntR family  53.27 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000455222 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  50.63 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  46.4 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  36.52 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  45 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  42.02 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  37.82 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  41.88 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  41.74 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1484  regulatory protein GntR HTH  55.84 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00605871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  41.23 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  44.58 
 
 		 165 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  35.9 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0668  regulatory protein GntR HTH  50.88 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000391689  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  36.13 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2299  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 258 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.171843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  36.44 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  46.84 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  45.12 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  46.38 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  44.16 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  44.16 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  44.16 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  44.16 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  40.51 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.58 
 
 		 473 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  49.32 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2563  transcriptional regulator  52.46 
 
 		 434 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  26.09 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.83 
 
 		 444 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 432 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3852  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 324 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.62358  normal  0.635405 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  45.33 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 444 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.83 
 
 		 444 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  45.33 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 444 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 444 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>