225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2692 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  100 
 
 		 450 aa  912    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  72.56 
 
 		 448 aa  671    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  60.92 
 
 		 454 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  60.56 
 
 		 441 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  58.78 
 
 		 453 aa  510  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  55.64 
 
 		 454 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  58.57 
 
 		 446 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  55.63 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  58.67 
 
 		 468 aa  480  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  56.44 
 
 		 455 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  58.44 
 
 		 461 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  56.39 
 
 		 432 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  54.2 
 
 		 456 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  57.36 
 
 		 484 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  48.66 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  53.77 
 
 		 442 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  50.9 
 
 		 434 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  50.26 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  48.54 
 
 		 441 aa  435  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  49.66 
 
 		 480 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  48.09 
 
 		 445 aa  428  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  48.97 
 
 		 448 aa  426  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  47.52 
 
 		 470 aa  398  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  49.16 
 
 		 460 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  46.88 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  34.52 
 
 		 493 aa  203  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  31.59 
 
 		 555 aa  199  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.3 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.47 
 
 		 370 aa  179  7e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.81 
 
 		 365 aa  169  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  28.47 
 
 		 370 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.35 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  31.51 
 
 		 368 aa  166  9e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.33 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  33.24 
 
 		 376 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.72 
 
 		 386 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  31.4 
 
 		 384 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  36.29 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  31.66 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.82 
 
 		 374 aa  118  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  28.96 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.02 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  27.99 
 
 		 454 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.75 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0069  hypothetical protein  28.45 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.94 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.7 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  31.42 
 
 		 353 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.08 
 
 		 411 aa  104  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  25.88 
 
 		 439 aa  104  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.73 
 
 		 440 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.09 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.48 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.25 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.91 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  26.47 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.8 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.71 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  29.87 
 
 		 375 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.36 
 
 		 340 aa  101  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.99 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1321  hypothetical protein  28.63 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.63 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.13 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3766  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.13 
 
 		 351 aa  100  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0375  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.74 
 
 		 345 aa  100  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0720  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  28.46 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3819  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.46 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.651566  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.86 
 
 		 437 aa  99.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3673  KamA family iron-sulfur cluster-binding protein  28.46 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  29.96 
 
 		 335 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  30.97 
 
 		 527 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.44 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  26.22 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.2 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29 
 
 		 413 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.96 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  32.46 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.44 
 
 		 415 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3944  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.35 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30 
 
 		 350 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.45 
 
 		 337 aa  96.7  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0465  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.85 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  31.25 
 
 		 438 aa  96.3  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  29.96 
 
 		 335 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.74 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0332  L-lysine 2,3-aminomutase  27.34 
 
 		 342 aa  95.9  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000384662 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.36 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.51 
 
 		 363 aa  95.5  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4615  KamA family protein  27.95 
 
 		 342 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.337452 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.18 
 
 		 454 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  25.23 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29 
 
 		 381 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.67 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  26.42 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  26.58 
 
 		 416 aa  94.4  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  30.46 
 
 		 364 aa  94.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.8 
 
 		 460 aa  94  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>