More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2691 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2691  aminotransferase class I and II  100 
 
 
419 aa  825    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2772  aminotransferase, class I and II  69.23 
 
 
418 aa  552  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23570  aminotransferase  50.12 
 
 
415 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.931862  normal  0.40815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2253  aminotransferase  48.54 
 
 
430 aa  362  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0583  aminotransferase class I and II  48.56 
 
 
442 aa  351  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9291  aminotransferase  50 
 
 
426 aa  346  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4950  aminotransferase class I and II  44.31 
 
 
416 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2617  aminotransferase class I and II  48.43 
 
 
446 aa  318  9e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000150175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2568  aminotransferase class I and II  49.15 
 
 
402 aa  312  9e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320614  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3500  aminotransferase, class I and II  35.42 
 
 
431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00165234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2554  aminotransferase  37.12 
 
 
438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0255336  normal  0.0169818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1034  aminotransferase  35.48 
 
 
440 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1573  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase, AspC-like  29.57 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  31.09 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  29.58 
 
 
386 aa  131  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  33.6 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  32.57 
 
 
398 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0079  aminotransferase class I and II  31.43 
 
 
392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  31.35 
 
 
396 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  30.69 
 
 
400 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  28.79 
 
 
397 aa  124  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0865  class I/II aminotransferase  25.56 
 
 
452 aa  123  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0193315 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  27.8 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  31.36 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  30.85 
 
 
397 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  30.58 
 
 
399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1459  aminotransferase, class I and II  26.27 
 
 
446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  25.54 
 
 
385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  30.33 
 
 
383 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  28.39 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  32.57 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  29.14 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  30.34 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  30.34 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  28.87 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  29.49 
 
 
399 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  29.44 
 
 
395 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  28.35 
 
 
387 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  29.44 
 
 
395 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  29.33 
 
 
395 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  29.33 
 
 
395 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  29.33 
 
 
395 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  29.33 
 
 
395 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  29.33 
 
 
395 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  28.72 
 
 
400 aa  116  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  28.34 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  28.61 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  28.57 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  28.01 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  29.44 
 
 
395 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  30.15 
 
 
393 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  28.49 
 
 
400 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  28.49 
 
 
388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  28.02 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  29.9 
 
 
397 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  31.83 
 
 
393 aa  113  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  31.22 
 
 
392 aa  113  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  29.18 
 
 
395 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  30.16 
 
 
401 aa  113  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  31.89 
 
 
405 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  31.38 
 
 
393 aa  112  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  32.02 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  27.81 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  32.02 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  28.57 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  28.42 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  31.08 
 
 
392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  30.53 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  28.86 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  27.93 
 
 
401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  27.16 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  31.33 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  29.81 
 
 
393 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  29.21 
 
 
397 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  28.54 
 
 
397 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2478  aspartate aminotransferase  25.96 
 
 
377 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  28.83 
 
 
404 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  31.4 
 
 
383 aa  110  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  30.12 
 
 
397 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  32.03 
 
 
405 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  29.72 
 
 
396 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  27.93 
 
 
400 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  25.32 
 
 
395 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  25.81 
 
 
387 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  24.47 
 
 
374 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  26.09 
 
 
396 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  27.78 
 
 
396 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  28.57 
 
 
389 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  30.31 
 
 
393 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  26.12 
 
 
400 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  28.45 
 
 
379 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  22.89 
 
 
373 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  30.26 
 
 
402 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  28.15 
 
 
388 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  29.1 
 
 
389 aa  107  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  28.33 
 
 
395 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  28.21 
 
 
401 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  29.02 
 
 
400 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  33.47 
 
 
384 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  31.41 
 
 
400 aa  107  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>