More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23570 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23570  aminotransferase  100 
 
 		 415 aa  820    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.931862  normal  0.40815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9291  aminotransferase  57.32 
 
 		 426 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4950  aminotransferase class I and II  51.09 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2253  aminotransferase  52.08 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0583  aminotransferase class I and II  52.4 
 
 		 442 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2617  aminotransferase class I and II  55.21 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000150175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2691  aminotransferase class I and II  50.12 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2772  aminotransferase, class I and II  47.1 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2568  aminotransferase class I and II  53.66 
 
 		 402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320614  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3500  aminotransferase, class I and II  34.86 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00165234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1573  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase, AspC-like  32.61 
 
 		 423 aa  206  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1034  aminotransferase  36.1 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2554  aminotransferase  36.06 
 
 		 438 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0255336  normal  0.0169818 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0865  class I/II aminotransferase  29.81 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0193315 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  29.66 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  30.95 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  28.98 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  31.27 
 
 		 390 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0079  aminotransferase class I and II  31.52 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  29.5 
 
 		 392 aa  137  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  31.27 
 
 		 390 aa  133  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  29.5 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  30.13 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  29.33 
 
 		 383 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  30.23 
 
 		 400 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  30.39 
 
 		 400 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  30.39 
 
 		 400 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  34.95 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  28.98 
 
 		 400 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  30.13 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  29.87 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  34.03 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  29.5 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  29.5 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  29.5 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  29.5 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  29.5 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  30.71 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  29.87 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  28.12 
 
 		 400 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  29.97 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  29.71 
 
 		 383 aa  130  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  29.27 
 
 		 400 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  29.27 
 
 		 400 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  30.29 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  27.03 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  29.61 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  31.27 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  32.55 
 
 		 402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  31.2 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  27.1 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  31.88 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  27.4 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  27.84 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  30.03 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  28.5 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  27.79 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  29.02 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  29.43 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  29.68 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  28.61 
 
 		 397 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  29.46 
 
 		 400 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  29.5 
 
 		 400 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  28.79 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  30.38 
 
 		 398 aa  126  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  28.35 
 
 		 395 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  28.39 
 
 		 400 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  30.67 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  28.54 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  27.39 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2591  aspartate aminotransferase  28.79 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2245  aminotransferase class I and II  30.56 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154581  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  30.18 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  27.39 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  31.37 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  30.4 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  28.98 
 
 		 400 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  29.95 
 
 		 401 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  31.82 
 
 		 393 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  27.13 
 
 		 390 aa  123  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  28.57 
 
 		 400 aa  123  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  29.35 
 
 		 400 aa  123  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  30 
 
 		 396 aa  122  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  27.27 
 
 		 401 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  31.51 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  28.83 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  28.53 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  28.35 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  27.46 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  27.13 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  28.68 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  29.95 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  28.61 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  25.71 
 
 		 387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  27.27 
 
 		 401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  28.31 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  30.98 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  28.68 
 
 		 396 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  31.84 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>