More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2772 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2772  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 418 aa  830    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2691  aminotransferase class I and II  69.23 
 
 		 419 aa  531  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23570  aminotransferase  47.1 
 
 		 415 aa  358  7e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.931862  normal  0.40815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0583  aminotransferase class I and II  47.72 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2253  aminotransferase  47.91 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4950  aminotransferase class I and II  45.65 
 
 		 416 aa  342  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9291  aminotransferase  47.69 
 
 		 426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2617  aminotransferase class I and II  47.93 
 
 		 446 aa  323  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000150175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2568  aminotransferase class I and II  49.39 
 
 		 402 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320614  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3500  aminotransferase, class I and II  35.68 
 
 		 431 aa  203  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00165234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1573  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase, AspC-like  33.52 
 
 		 423 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1034  aminotransferase  36.29 
 
 		 440 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2554  aminotransferase  33.7 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0255336  normal  0.0169818 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0079  aminotransferase class I and II  31.52 
 
 		 392 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1459  aminotransferase, class I and II  28.44 
 
 		 446 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  32.06 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  31.2 
 
 		 397 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  31.61 
 
 		 398 aa  126  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0890  aminotransferase class I and II  31.14 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  29.74 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  31.18 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  28.5 
 
 		 397 aa  123  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  32.44 
 
 		 393 aa  123  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  30.89 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  30.33 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  28.8 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  27.94 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  27.23 
 
 		 397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  29.34 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  30.15 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  29.95 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  27.65 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  29.67 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  30.81 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  30.77 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  28.46 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  32.64 
 
 		 413 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  29.73 
 
 		 386 aa  116  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  29.68 
 
 		 395 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  29.63 
 
 		 400 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  29.16 
 
 		 397 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  30.42 
 
 		 402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  30.08 
 
 		 402 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  29.14 
 
 		 395 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  29.18 
 
 		 398 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  29.49 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  28.83 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  29.49 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  29.49 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  29.49 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  29.49 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  29.79 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  29.14 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  31.05 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  29.74 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  26.03 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  25.7 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  29.12 
 
 		 387 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  29.01 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07350  putative aspartate aminotransferase  27.88 
 
 		 399 aa  114  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  28.68 
 
 		 394 aa  113  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  30 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0746  aminotransferase class I and II  32.53 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000316977  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  27.81 
 
 		 393 aa  113  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  26.61 
 
 		 380 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  28.92 
 
 		 390 aa  113  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  28.32 
 
 		 399 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  29.84 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  30.1 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  29.41 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  26.75 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  29.72 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  26.17 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  25.32 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  29.66 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  34.71 
 
 		 384 aa  111  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  28.68 
 
 		 392 aa  111  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  29.79 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  29.1 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  29.87 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  27.95 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  29.01 
 
 		 401 aa  109  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  27.68 
 
 		 402 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  29.13 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  30.26 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  27.72 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  29.2 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  29.2 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  31.36 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  27.86 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0865  class I/II aminotransferase  25.23 
 
 		 452 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0193315 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  28.44 
 
 		 388 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  29.52 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  27.07 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  28.19 
 
 		 392 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  30.11 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  28.94 
 
 		 409 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  26.98 
 
 		 398 aa  106  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  28.54 
 
 		 408 aa  106  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  24.27 
 
 		 387 aa  106  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>