More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2253 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2253  aminotransferase  100 
 
 		 430 aa  847    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0583  aminotransferase class I and II  71.29 
 
 		 442 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4950  aminotransferase class I and II  58.98 
 
 		 416 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2617  aminotransferase class I and II  64.24 
 
 		 446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000150175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9291  aminotransferase  62.95 
 
 		 426 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2568  aminotransferase class I and II  61.26 
 
 		 402 aa  433  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320614  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23570  aminotransferase  52.08 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.931862  normal  0.40815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2772  aminotransferase, class I and II  47.91 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2691  aminotransferase class I and II  48.54 
 
 		 419 aa  344  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2554  aminotransferase  38.44 
 
 		 438 aa  206  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0255336  normal  0.0169818 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1573  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase, AspC-like  34.22 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3500  aminotransferase, class I and II  34.68 
 
 		 431 aa  189  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00165234  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1034  aminotransferase  37.14 
 
 		 440 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  34.66 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  29.52 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  31.04 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  30.53 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  30.28 
 
 		 395 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  30.28 
 
 		 395 aa  149  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  30.28 
 
 		 395 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  30.28 
 
 		 395 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  30.28 
 
 		 395 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  30.28 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  29.77 
 
 		 395 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  32.55 
 
 		 390 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  32.41 
 
 		 393 aa  146  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  29.95 
 
 		 395 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  26.89 
 
 		 385 aa  146  9e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  30.03 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  29.4 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  29.35 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  28.46 
 
 		 402 aa  145  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  32.83 
 
 		 398 aa  143  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  27.16 
 
 		 395 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  31.99 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  30.23 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  28.05 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  31.06 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0865  class I/II aminotransferase  29.6 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0193315 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2245  aminotransferase class I and II  30.73 
 
 		 397 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  27.79 
 
 		 397 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  29.09 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  29.12 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  31.25 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  27.25 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  28.12 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  29.02 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  29.44 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  32.64 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  31.79 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  26.84 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  29.59 
 
 		 397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  29.53 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  29.07 
 
 		 400 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  29.07 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  29.01 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  29.32 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  30.3 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  29.08 
 
 		 392 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  28.61 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  31.83 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  30.5 
 
 		 400 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  29.34 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  30 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  30.48 
 
 		 400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 		 400 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  28.04 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  29 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  27.2 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  29.57 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  28.76 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  30.91 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  27.11 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  27.27 
 
 		 375 aa  126  9e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1377  aromatic amino acid aminotransferase  29.35 
 
 		 400 aa  126  9e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.907839  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  26.8 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  30.77 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  29.47 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  32.39 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  27.79 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  28.79 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  29.8 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  31.28 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  26.4 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  26.53 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  25.99 
 
 		 373 aa  124  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  31.69 
 
 		 400 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  30.53 
 
 		 381 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  27.2 
 
 		 392 aa  123  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  31.77 
 
 		 400 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  26.1 
 
 		 380 aa  123  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  31.61 
 
 		 391 aa  122  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  28.89 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  28.68 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2598  hypothetical protein  27.64 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2454  hypothetical protein  27.64 
 
 		 388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  27.46 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  28.96 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  31.51 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  30.41 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>