More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1573 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1573  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase, AspC-like  100 
 
 		 423 aa  867    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2554  aminotransferase  44.5 
 
 		 438 aa  352  7e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0255336  normal  0.0169818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3500  aminotransferase, class I and II  42.32 
 
 		 431 aa  345  6e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00165234  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0865  class I/II aminotransferase  37.28 
 
 		 452 aa  280  4e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0193315 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1034  aminotransferase  41.95 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1459  aminotransferase, class I and II  33.06 
 
 		 446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4950  aminotransferase class I and II  33.81 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2253  aminotransferase  34.22 
 
 		 430 aa  201  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23570  aminotransferase  32.61 
 
 		 415 aa  199  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.931862  normal  0.40815 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  32.08 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0583  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 442 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 		 390 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  33.51 
 
 		 390 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2772  aminotransferase, class I and II  33.52 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  31.79 
 
 		 397 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  29.47 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  33.24 
 
 		 397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  29.79 
 
 		 397 aa  183  6e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2617  aminotransferase class I and II  35.92 
 
 		 446 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000150175  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  31.47 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  33.96 
 
 		 392 aa  180  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 393 aa  179  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  32.43 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  33.69 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0079  aminotransferase class I and II  32.14 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  31.86 
 
 		 388 aa  177  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  30.89 
 
 		 400 aa  176  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  29.73 
 
 		 385 aa  176  8e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  31.13 
 
 		 400 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  31.35 
 
 		 400 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  30.62 
 
 		 400 aa  176  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  31.17 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  31.44 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  30.75 
 
 		 390 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  30.79 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  30.81 
 
 		 400 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  30.54 
 
 		 400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  30.54 
 
 		 400 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  31.69 
 
 		 400 aa  173  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  32.98 
 
 		 407 aa  173  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  31.78 
 
 		 387 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  31.35 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  30.62 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  30.73 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  30.73 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  30.73 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  30.89 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  30.73 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  31 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  31 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  31 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  32.52 
 
 		 398 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  30.73 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  31 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  31 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2245  aminotransferase class I and II  31.27 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154581  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  33.42 
 
 		 452 aa  170  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  32.35 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  30.54 
 
 		 401 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  32.41 
 
 		 389 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  30.16 
 
 		 397 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  30.29 
 
 		 393 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  29.81 
 
 		 400 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  31.02 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  30.63 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  31.93 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  31 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  32.88 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  30 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  32.25 
 
 		 411 aa  166  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  28.42 
 
 		 397 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  29.36 
 
 		 397 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  31.88 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  28.72 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  29.46 
 
 		 400 aa  166  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  30.24 
 
 		 401 aa  166  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  32.49 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  29.55 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  33.6 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  30.1 
 
 		 400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  29.09 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  30.73 
 
 		 388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  27.83 
 
 		 395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  30.1 
 
 		 400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  31.83 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  28.34 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  31.4 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2568  aminotransferase class I and II  32.3 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320614  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  30.08 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  31.9 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  30.11 
 
 		 398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  31.98 
 
 		 414 aa  163  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  32.81 
 
 		 386 aa  163  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3038  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 406 aa  163  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000279526 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  31.28 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  33.53 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  32.16 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  29.14 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  30.54 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>