More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0583 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0583  aminotransferase class I and II  100 
 
 
442 aa  859    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2253  aminotransferase  71.29 
 
 
430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4950  aminotransferase class I and II  58.99 
 
 
416 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9291  aminotransferase  63.42 
 
 
426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2617  aminotransferase class I and II  63.29 
 
 
446 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000150175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2568  aminotransferase class I and II  59.86 
 
 
402 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320614  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23570  aminotransferase  52.4 
 
 
415 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.931862  normal  0.40815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2772  aminotransferase, class I and II  47.72 
 
 
418 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2691  aminotransferase class I and II  48.56 
 
 
419 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1573  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase, AspC-like  33.33 
 
 
423 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2554  aminotransferase  35.52 
 
 
438 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0255336  normal  0.0169818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1034  aminotransferase  37.04 
 
 
440 aa  192  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3500  aminotransferase, class I and II  34.29 
 
 
431 aa  186  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00165234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  31.7 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  30 
 
 
395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  30 
 
 
395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  30 
 
 
395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  30 
 
 
395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  30 
 
 
395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  30.26 
 
 
395 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  29.74 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  30 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  29.74 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  31.28 
 
 
393 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  30 
 
 
395 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  29.87 
 
 
383 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  29.23 
 
 
395 aa  133  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  29.05 
 
 
383 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  30.08 
 
 
398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  30.77 
 
 
396 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  30.36 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0865  class I/II aminotransferase  29.37 
 
 
452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0193315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  30.08 
 
 
392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  28.09 
 
 
397 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  26.21 
 
 
395 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  25.25 
 
 
402 aa  124  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  26.75 
 
 
385 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  29.41 
 
 
396 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  28.06 
 
 
399 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  27.65 
 
 
387 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  27.84 
 
 
397 aa  123  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  27.47 
 
 
397 aa  123  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2245  aminotransferase class I and II  29.95 
 
 
397 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154581  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  28.13 
 
 
394 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  28.83 
 
 
398 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  28.33 
 
 
400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  31.39 
 
 
390 aa  120  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  27.2 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  30.28 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1459  aminotransferase, class I and II  26.69 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  26.42 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  28.04 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  27.83 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  26.28 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  28.08 
 
 
400 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0079  aminotransferase class I and II  29.79 
 
 
392 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  30.71 
 
 
393 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  28.13 
 
 
388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  26.88 
 
 
379 aa  116  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  29.29 
 
 
400 aa  116  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  27.98 
 
 
400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  26.46 
 
 
402 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  28.05 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  28.53 
 
 
400 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  27.69 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0674  L-aspartate aminotransferase  25.7 
 
 
392 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  26.33 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  28.04 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  25.81 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  27.59 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  25.77 
 
 
392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  27.95 
 
 
386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  30.73 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  27.23 
 
 
398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1377  aromatic amino acid aminotransferase  29.72 
 
 
400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.907839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  29.47 
 
 
401 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  28.36 
 
 
400 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  28.53 
 
 
389 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  29.85 
 
 
400 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07291  aminotransferases class-I  24.68 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.122313  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  28.86 
 
 
400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  30.13 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  24.74 
 
 
395 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  28.64 
 
 
400 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  27.65 
 
 
388 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  30.59 
 
 
400 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  30.59 
 
 
400 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0746  aminotransferase class I and II  31.76 
 
 
387 aa  110  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000316977  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  23.1 
 
 
390 aa  110  7.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  29.85 
 
 
397 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07271  aminotransferases class-I  24.43 
 
 
392 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.232753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  26.14 
 
 
397 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  31.17 
 
 
391 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  27.39 
 
 
397 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  28.07 
 
 
400 aa  109  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  28.32 
 
 
392 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  29.31 
 
 
400 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  26.29 
 
 
399 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  27.85 
 
 
388 aa  108  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  26.94 
 
 
400 aa  108  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>