More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1199 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  62.56 
 
 		 203 aa  241  6e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  53.96 
 
 		 215 aa  181  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  51.22 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  47.93 
 
 		 226 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  47.93 
 
 		 226 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  47.93 
 
 		 226 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  50.93 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  46.38 
 
 		 220 aa  161  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  47.69 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  44.06 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  45.54 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  46.51 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  41.15 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  41.58 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  39.9 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  41 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  41.79 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  39.32 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  43.35 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  42.08 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  39.5 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  37.69 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  37.56 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  41.79 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 370 aa  95.9  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 		 214 aa  95.5  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 		 226 aa  95.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.71 
 
 		 442 aa  95.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.89 
 
 		 222 aa  94.4  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  36.2 
 
 		 194 aa  94.7  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.89 
 
 		 222 aa  94.4  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.93 
 
 		 213 aa  94.4  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 412 aa  94.4  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  37.74 
 
 		 226 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  39.29 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.95 
 
 		 442 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.71 
 
 		 214 aa  92  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 		 223 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 195 aa  89  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.92 
 
 		 449 aa  88.2  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 224 aa  88.2  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  38.58 
 
 		 210 aa  88.2  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 		 223 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  35.63 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  35.63 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  35.63 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  35.63 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  35.06 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 		 402 aa  85.9  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  40.25 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 448 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.73 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 448 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  30.13 
 
 		 272 aa  84.7  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 229 aa  84.7  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  29.32 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 445 aa  82.4  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 452 aa  82  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  38.31 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>