More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1859 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1859  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 549 aa  1108    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2440  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.25 
 
 		 578 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485552  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  56 
 
 		 585 aa  569  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8813  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.37 
 
 		 601 aa  566  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.82 
 
 		 652 aa  565  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.45 
 
 		 562 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3883  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.61 
 
 		 530 aa  558  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0425  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.85 
 
 		 547 aa  555  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.912132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.35 
 
 		 573 aa  555  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19710  hydroxymethylpyrimidine synthase  63.57 
 
 		 554 aa  552  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00821817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0650  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.79 
 
 		 568 aa  555  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1249  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34570  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.07 
 
 		 548 aa  552  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.13 
 
 		 606 aa  554  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4274  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.03 
 
 		 530 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662161  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.39 
 
 		 561 aa  554  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.5 
 
 		 586 aa  548  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.52 
 
 		 586 aa  545  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.52 
 
 		 586 aa  545  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.52 
 
 		 586 aa  546  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.52 
 
 		 586 aa  546  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.52 
 
 		 586 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5347  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.52 
 
 		 586 aa  545  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.52 
 
 		 586 aa  545  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.85 
 
 		 573 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5612  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.52 
 
 		 586 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.188984  hitchhiker  0.0000000000000085296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.52 
 
 		 586 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.11 
 
 		 567 aa  545  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1454  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.2 
 
 		 587 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.323414  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3703  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.31 
 
 		 564 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.07 
 
 		 586 aa  542  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0916  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.47 
 
 		 516 aa  545  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584665  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0446  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.98 
 
 		 611 aa  540  9.999999999999999e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1924  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.44 
 
 		 609 aa  538  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471562  normal  0.405716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3737  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.73 
 
 		 566 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.871211  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4570  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.84 
 
 		 631 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0133622 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4496  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.84 
 
 		 631 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124533 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4407  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.13 
 
 		 631 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679063  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2096  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.38 
 
 		 683 aa  531  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4494  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.84 
 
 		 631 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0642711  normal  0.0188033 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0455  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.52 
 
 		 681 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000571171 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4374  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.06 
 
 		 631 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.701948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0041  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.47 
 
 		 622 aa  534  1e-150  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.321035  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0347  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.3 
 
 		 681 aa  531  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0487  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.68 
 
 		 629 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2487  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.52 
 
 		 626 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320621  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0078  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.17 
 
 		 627 aa  534  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10428  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.75 
 
 		 547 aa  531  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00121704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3853  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.52 
 
 		 681 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0725  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.95 
 
 		 516 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186933 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03871  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.68 
 
 		 631 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4000  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.4 
 
 		 631 aa  529  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4536  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.4 
 
 		 631 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2710  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.8 
 
 		 624 aa  531  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5462  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.4 
 
 		 631 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.416651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0284  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.65 
 
 		 647 aa  529  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835607 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03824  hypothetical protein  57.68 
 
 		 631 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0216  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.86 
 
 		 651 aa  528  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0207  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.4 
 
 		 630 aa  530  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00146  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.17 
 
 		 642 aa  530  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839696  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0019  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.14 
 
 		 638 aa  531  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.691133  normal  0.432221 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4485  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.17 
 
 		 631 aa  529  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1824  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.25 
 
 		 626 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.484584  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2530  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.47 
 
 		 628 aa  531  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0037  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.71 
 
 		 638 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002072  thiamin biosynthesis protein ThiC  56.54 
 
 		 646 aa  529  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2370  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.87 
 
 		 630 aa  531  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4031  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.4 
 
 		 631 aa  529  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0125326 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4442  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.62 
 
 		 631 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000546852 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4228  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.4 
 
 		 631 aa  529  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0250  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.9 
 
 		 658 aa  527  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07900  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.77 
 
 		 607 aa  527  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0286039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0492  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.58 
 
 		 629 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0943388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2227  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.59 
 
 		 605 aa  528  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0220  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.86 
 
 		 646 aa  528  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.464551  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00366  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.1 
 
 		 646 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0140  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.3 
 
 		 629 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.579099  normal  0.193074 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0369  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.73 
 
 		 638 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0621  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.53 
 
 		 609 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2054  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.3 
 
 		 608 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4714  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.8 
 
 		 628 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.35194 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3870  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.91 
 
 		 655 aa  528  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0803  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.73 
 
 		 654 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4922  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.58 
 
 		 626 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.66 
 
 		 630 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0544  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.14 
 
 		 629 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2272  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.1 
 
 		 666 aa  523  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4798  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.58 
 
 		 626 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0965  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.85 
 
 		 606 aa  523  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.831801  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4975  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.8 
 
 		 626 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2561  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.96 
 
 		 608 aa  524  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117282  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38085  predicted protein  58.03 
 
 		 619 aa  525  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2201  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.43 
 
 		 666 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1077  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.19 
 
 		 618 aa  525  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.017294  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2466  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.18 
 
 		 627 aa  522  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.387254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2944  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.37 
 
 		 599 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.858401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2392  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.29 
 
 		 680 aa  525  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.494213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4976  thiamin biosynthesis protein ThiC  54.92 
 
 		 629 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2013  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.77 
 
 		 652 aa  518  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715705  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1770  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.68 
 
 		 686 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0093  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.56 
 
 		 628 aa  519  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.447286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>