More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1808 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1808  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 357 aa  706    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 353 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2619  peptide chain release factor 1  52.29 
 
 		 357 aa  353  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254824  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2352  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 357 aa  352  5e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000547652 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 357 aa  352  7e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0888  peptide chain release factor 1  53.62 
 
 		 350 aa  351  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  47.31 
 
 		 356 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 355 aa  348  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  50.68 
 
 		 361 aa  348  7e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  48.58 
 
 		 356 aa  348  8e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  50.44 
 
 		 361 aa  347  1e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 357 aa  348  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  51 
 
 		 355 aa  347  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1656  peptide chain release factor 1  52.17 
 
 		 350 aa  346  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  44.79 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  44.79 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  52.87 
 
 		 356 aa  345  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  50.9 
 
 		 359 aa  344  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  52.86 
 
 		 355 aa  344  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0641  peptide chain release factor 1  57.01 
 
 		 364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  51.48 
 
 		 359 aa  343  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  47.86 
 
 		 358 aa  342  7e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  47.86 
 
 		 358 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  47.86 
 
 		 355 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  47.86 
 
 		 358 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  47.86 
 
 		 358 aa  342  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  47.86 
 
 		 358 aa  342  8e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  47.86 
 
 		 355 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  47.86 
 
 		 358 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  50.88 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 355 aa  341  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3873  peptide chain release factor 1  54.05 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3887  peptide chain release factor 1  54.05 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3961  peptide chain release factor 1  54.05 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  47.58 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  47.74 
 
 		 362 aa  339  4e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2419  peptide chain release factor 1  52.72 
 
 		 355 aa  338  7e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.922635  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  45.19 
 
 		 362 aa  338  8e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  47.58 
 
 		 355 aa  338  9e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 		 356 aa  338  9e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 355 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 		 358 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 354 aa  337  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  46.18 
 
 		 357 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  47.56 
 
 		 356 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  54.07 
 
 		 355 aa  335  7e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 357 aa  335  9e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119961 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  48.42 
 
 		 363 aa  333  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  48.84 
 
 		 358 aa  333  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3931  peptide chain release factor 1  51.98 
 
 		 361 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1652  peptide chain release factor 1  53.62 
 
 		 364 aa  333  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.534857  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  45.89 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2459  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 358 aa  333  4e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3720  peptide chain release factor 1  51.8 
 
 		 357 aa  332  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4339  peptide chain release factor 1  52.31 
 
 		 357 aa  332  6e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  51.83 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  48.15 
 
 		 362 aa  331  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  47.18 
 
 		 362 aa  331  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  45.79 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 357 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  51.53 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11326  peptide chain release factor 1  51.16 
 
 		 357 aa  329  4e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 		 360 aa  328  6e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  47.03 
 
 		 355 aa  328  6e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6150  peptide chain release factor 1  51.15 
 
 		 354 aa  329  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.749977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 		 358 aa  328  7e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1751  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 357 aa  328  8e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102915  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3644  peptide chain release factor 1  53.94 
 
 		 362 aa  328  9e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  50.93 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  48.15 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4026  peptide chain release factor 1  53.64 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29910  peptide chain release factor 1  51.45 
 
 		 358 aa  326  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363268 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  47.34 
 
 		 359 aa  326  3e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  48.82 
 
 		 360 aa  327  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  46.83 
 
 		 355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1785  peptide chain release factor 1  52.41 
 
 		 361 aa  326  5e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  47.97 
 
 		 355 aa  325  9e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1286  peptide chain release factor 1  53.64 
 
 		 373 aa  325  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.258232 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  50.62 
 
 		 359 aa  324  1e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  50.3 
 
 		 360 aa  325  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  45.74 
 
 		 367 aa  324  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  52.76 
 
 		 360 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  45.76 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  46.13 
 
 		 355 aa  323  3e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  47.63 
 
 		 370 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  46.22 
 
 		 363 aa  323  4e-87  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 360 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 360 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>