More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1716 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1716  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 153 aa  297  4e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.3 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  46.62 
 
 		 150 aa  150  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.75 
 
 		 155 aa  146  8e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 		 150 aa  146  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  48.3 
 
 		 193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.98 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 146 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 147 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  46.53 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 193 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 193 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 193 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.04 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.26 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  42.96 
 
 		 152 aa  140  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 		 173 aa  140  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  45.27 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  51.7 
 
 		 147 aa  140  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 155 aa  139  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.45 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  55.3 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  55.1 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  43.75 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.85 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  41.67 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.95 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 142 aa  138  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  52 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1422  3-dehydroquinate dehydratase  50.33 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  40.28 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 		 149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  51.09 
 
 		 145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 144 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  51.02 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 150 aa  137  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  41.67 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  45.95 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  40.28 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  40.28 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  48 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 142 aa  137  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.17 
 
 		 142 aa  136  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 151 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  44.14 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 149 aa  135  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  45.65 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.32 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  39.58 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  54.69 
 
 		 141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  45.93 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  42.66 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  41.5 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  41.38 
 
 		 145 aa  133  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0067  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.92 
 
 		 139 aa  133  9e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463951  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 191 aa  133  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>