More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1502 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1502  signal recognition particle protein  100 
 
 		 443 aa  858    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  52.27 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  56.15 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  54.65 
 
 		 516 aa  441  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  52.73 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  53.24 
 
 		 522 aa  438  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  54.99 
 
 		 524 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  54.65 
 
 		 517 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  51.76 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.97 
 
 		 446 aa  433  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0661  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.22 
 
 		 535 aa  428  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  54.11 
 
 		 479 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  51.87 
 
 		 450 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  50.35 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1190  signal recognition particle protein  53.74 
 
 		 514 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260849  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.72 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  50 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  51.08 
 
 		 448 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.49 
 
 		 515 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  52.54 
 
 		 515 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  55.66 
 
 		 514 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  50.35 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  52.64 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  50.91 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.05 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  50.85 
 
 		 535 aa  421  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.44 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  52.25 
 
 		 469 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  50.35 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.93 
 
 		 551 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2243  signal recognition particle protein  52.84 
 
 		 519 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739942  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  52.36 
 
 		 518 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2181  signal recognition particle protein  52.27 
 
 		 522 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  52.91 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  51.87 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  52.14 
 
 		 446 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  50.94 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  52.68 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3266  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.19 
 
 		 523 aa  418  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0903561  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0223  signal recognition particle protein  52.67 
 
 		 531 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0328  signal recognition particle protein  50 
 
 		 556 aa  412  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.59605 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.9 
 
 		 527 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1468  signal recognition particle protein  51.71 
 
 		 536 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  52.5 
 
 		 521 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  46.71 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1959  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.88 
 
 		 520 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1939  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.88 
 
 		 520 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2005  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.88 
 
 		 520 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182683  normal  0.803066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  51.97 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  47.15 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09950  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.68 
 
 		 530 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0229355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4011  signal recognition particle protein  53.01 
 
 		 528 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.923064  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2229  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 527 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1165  signal recognition particle protein  52.62 
 
 		 532 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196377  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  49.14 
 
 		 525 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2489  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.23 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.277512  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  47.76 
 
 		 439 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  48.48 
 
 		 455 aa  403  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  51.63 
 
 		 528 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  51.03 
 
 		 515 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10980  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.88 
 
 		 604 aa  403  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160469  normal  0.0249025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12930  signal recognition particle protein ffh  52.9 
 
 		 525 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.569051 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.45 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09140  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.15 
 
 		 528 aa  404  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  48.96 
 
 		 488 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  46.59 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.33 
 
 		 481 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  49.42 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  51.05 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  49.29 
 
 		 492 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  47.07 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  47.07 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  49.29 
 
 		 492 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1050  signal recognition particle GTPase  48.63 
 
 		 544 aa  397  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  49.17 
 
 		 493 aa  395  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  47.54 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  45.25 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  48.72 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  47 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.99 
 
 		 449 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  46.38 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.29 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  45.81 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  46.51 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3595  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.02 
 
 		 517 aa  391  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  47.02 
 
 		 492 aa  391  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  47 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  46.34 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  44.94 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.62 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>