More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0974 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0974  glycine cleavage H-protein  100 
 
 		 158 aa  321  3e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357877  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1073  glycine cleavage system protein H  37.76 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237871  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1076  glycine cleavage system protein H  38.46 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510975  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  37.4 
 
 		 138 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2035  glycine cleavage H-protein  35.42 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0973  glycine cleavage H-protein  36.17 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.714694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3134  glycine cleavage H-protein  38.82 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2208  glycine cleavage H-protein  35.51 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2175  glycine cleavage H-protein  36.15 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000381106 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1481  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.14622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2547  glycine cleavage system H protein, putative  36.15 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2869  glycine cleavage system H protein, putative  37.75 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2490  glycine cleavage H-protein  37.75 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1746  glycine cleavage H-protein  37.5 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.342973  normal  0.262336 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0640  glycine cleavage H-protein  37.61 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  40.34 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  41.03 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  37.98 
 
 		 127 aa  87.4  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  37.21 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  37.98 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2549  glycine cleavage system protein H, putative  35.66 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2177  glycine cleavage H-protein  35.66 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000031691 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  40.37 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  33.08 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  33.6 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  30.83 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  30.83 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  38.66 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  32.56 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0638  glycine cleavage H-protein  34.27 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  33.59 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  35.71 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  34.45 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  34.45 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  35.54 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  30.08 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  35.88 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  36 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  34.88 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  35.88 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  35.88 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  35.88 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  35.88 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  40.91 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  35.88 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2189  glycine cleavage system protein H  34.17 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  40.37 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1570  glycine cleavage H-protein  37.37 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0137365 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  35.59 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  35.11 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  35.11 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  35.11 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  35.59 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  31.25 
 
 		 125 aa  77  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  35.11 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  33.59 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  35.59 
 
 		 140 aa  77  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  35.11 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  37.1 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  31.78 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  35.09 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  35.11 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  37.9 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  33.61 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  32 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  36.57 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  33.58 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  35.09 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  35.11 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  34.78 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  34.78 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  32.03 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  35.83 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  37.12 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  35.83 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  30.53 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28911  glycine cleavage system protein H  32.5 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  33.59 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  30.47 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2210  glycine cleavage H-protein  32.17 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00775002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  35.54 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  32.58 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2836  glycine cleavage system H protein  36.27 
 
 		 120 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136421  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  37.29 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  30.71 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  33.61 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  34.85 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  32.06 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  34.85 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  34.78 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  34.82 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  34.35 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  31.78 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  35.25 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  35.38 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  32.28 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  32.48 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  40.57 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>