More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2836 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2836  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 120 aa  242  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136421  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  53.85 
 
 		 130 aa  140  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  51.79 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 		 124 aa  127  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  49.57 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  48.72 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  50.89 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  49.56 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  52.29 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  45.76 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  47.86 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  50.89 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  44.44 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  48.67 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  47.46 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  49.11 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  47.32 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01074  hypothetical glycine cleavage H-protein (Eurofung)  48.72 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  45 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  41.88 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  45.38 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  45.76 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 		 125 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  47.83 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  40.68 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  46.9 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  43.33 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  46.02 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  47.86 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  47.32 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  44.07 
 
 		 125 aa  117  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  48.7 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2681  glycine cleavage system protein H  48.28 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  44.35 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  42.86 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  45.76 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  43.7 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  43.7 
 
 		 131 aa  115  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  43.22 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3621  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.666557  normal  0.082734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  43.97 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  42.74 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2298  glycine cleavage system protein H  47.86 
 
 		 118 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0376  glycine cleavage system H protein  46.15 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  44.07 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  44.74 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  42.37 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  43.75 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2673  glycine cleavage system H protein  45.3 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  42.02 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  47.01 
 
 		 129 aa  113  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4267  glycine cleavage system H protein  42.02 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231851  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2194  glycine cleavage system protein H  47.01 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3154  glycine cleavage system H protein  46.15 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0869  glycine cleavage system protein H  47.01 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.731856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  47.37 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  40.17 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  45.3 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  41.18 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4374  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.44648  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75530  H-protein subunit of glycine cleavage system  46.15 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  42.74 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  44.54 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  43.97 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  44.54 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  44.07 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  41.38 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0244  glycine cleavage system H protein  43.36 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  45.69 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  45.13 
 
 		 129 aa  110  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  44.54 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  43.59 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  47.37 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  47.37 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  45.61 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  43.59 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  47.37 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>